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通过DNA-DNA杂交和脂肪酸分析研究三种“假奈瑟菌”（豚鼠奈瑟菌、兔奈瑟菌和绵羊奈瑟菌）的亲缘关系。

Relatedness of three species of "false neisseriae," Neisseria caviae, Neisseria cuniculi, and Neisseria ovis, by DNA-DNA hybridizations and fatty acid analysis.

作者信息

Véron M, Lenvoisé-Furet A, Coustère C, Ged C, Grimont F

机构信息

Laboratoire de Microbiologie, Faculté de Médecine Necker-Enfants Malades, Paris, France.

出版信息

Int J Syst Bacteriol. 1993 Apr;43(2):210-20. doi: 10.1099/00207713-43-2-210.

DOI:10.1099/00207713-43-2-210
PMID:8494736
Abstract

DNA-DNA hybridization was used to determine the levels of genomic relatedness of the three species of "false neisseriae," Neisseria caviae, Neisseria cuniculi, and Neisseria ovis. The reference strains of these species exhibited high levels of intraspecies relatedness (93 to 100% for N. caviae, 79 to 100% for N. cuniculi, and 68 to 100% for N. ovis) but low levels of interspecific relatedness (less than 34%) to each other and to various species belonging to the beta subclass of the Proteobacteria (Kingella kingae, Neisseria gonorrhoeae, Neisseria meningitidis, and Oligella urethralis) or to the gamma subclass (Branhamella catarrhalis, Kingella indologenes, Moraxella atlantae, Moraxella bovis, Moraxella lacunata subsp. lacunata, Moraxella lacunata subsp. liquefaciens, Moraxella nonliquefaciens, Moraxella osloensis, and Moraxella phenylpyruvica). However, the levels of DNA-DNA hybridization for the three species of "false neisseriae" were significantly higher with the species belonging to the gamma subclass (average, 13.7%) than with the species belonging to the beta subclass (average, 4.5%). These data suggest that N. caviae, N. cuniculi, and N. ovis are three separate genomic species in the gamma subclass. An ascendant hierarchical classification based only on fatty acid profiles distinguished four main classes containing (i) most of the "classical moraxellae," the "false neisseriae," and B. catarrhalis, (ii) only Acinetobacter spp., (iii) M. nonliquefaciens and "misnamed moraxellae" (M. atlantae, M. osloensis, and M. phenylpyruvica), and (iv) the "true neisseriae," the three Kingella species, and O. urethralis. Fatty acids that distinguish these four classes were identified. The fatty acid profiles of the two strains of Psychrobacter immobilis which we studied are not very similar to the profiles of the other taxa. Our results support the hypothesis that the three species of "false neisseriae," B. catarrhalis, the "classical moraxellae," and Acinetobacter spp. should be included in the same family.

摘要

采用DNA - DNA杂交技术来测定三种“假奈瑟菌”，即豚鼠奈瑟菌、兔奈瑟菌和羊奈瑟菌的基因组相关性水平。这些菌种的参考菌株在种内显示出高度相关性（豚鼠奈瑟菌为93%至100%，兔奈瑟菌为79%至100%，羊奈瑟菌为68%至100%），但彼此之间以及与属于变形菌纲β亚类的各种菌种（金氏金杆菌、淋病奈瑟菌、脑膜炎奈瑟菌和尿道寡源杆菌）或γ亚类（卡他布兰汉菌、产吲哚金氏菌、亚特兰大莫拉菌、牛莫拉菌、腔隙莫拉菌腔隙亚种、腔隙莫拉菌液化亚种、非液化莫拉菌奥斯陆亚种、奥斯陆莫拉菌和苯丙酮酸莫拉菌）的种间相关性水平较低（低于34%）。然而，三种“假奈瑟菌”与属于γ亚类的菌种的DNA - DNA杂交水平（平均为13.7%）显著高于与属于β亚类的菌种的杂交水平（平均为4.5%）。这些数据表明，豚鼠奈瑟菌

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