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使用短寡核苷酸引物文库通过毛细管电泳进行DNA测序。

DNA sequencing by capillary electrophoresis using short oligonucleotide primer libraries.

作者信息

Ruiz-Martinez M C, Carrilho E, Berka J, Kieleczawa J, Miller A W, Foret F, Carson S, Karger B L

机构信息

Northeastern University, Boston, MA, USA.

出版信息

Biotechniques. 1996 Jun;20(6):1058-64, 1066-9. doi: 10.2144/96206rr03.

Abstract

Two strategies for DNA sequencing by primer walking using short oligonucleotide primer libraries have been successfully employed along with capillary electrophoresis using replaceable polymer solutions of linear polyacrylamide and fluorescence detection. A 3.5-kb stretch of the single-stranded M13mp18 template was sequenced with T7 PRISM dye-terminator/Sequenase chemistry. An in-house base-calling program offered read lengths of roughly 450 bases with an average of 97.8% accuracy.

摘要

两种使用短寡核苷酸引物文库通过引物步移进行DNA测序的策略,已与使用线性聚丙烯酰胺可替换聚合物溶液及荧光检测的毛细管电泳成功结合使用。利用T7 PRISM染料终止剂/测序酶化学方法对单链M13mp18模板的一段3.5kb片段进行了测序。一个内部碱基识别程序提供了约450个碱基的读长,平均准确率为97.8%。

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