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在19号染色体q13.1上,一组四个新的人类G蛋白偶联受体基因紧密靠近CD22基因。

A cluster of four novel human G protein-coupled receptor genes occurring in close proximity to CD22 gene on chromosome 19q13.1.

作者信息

Sawzdargo M, George S R, Nguyen T, Xu S, Kolakowski L F, O'Dowd B F

机构信息

Department of Pharmacology, University of Toronto, Ontario, M5S 1A8, Canada.

出版信息

Biochem Biophys Res Commun. 1997 Oct 20;239(2):543-7. doi: 10.1006/bbrc.1997.7513.

Abstract

In our search for novel human galanin receptor (GALR) subtypes, human genomic DNA was PCR amplified using sets of degenerate primers based on conserved sequences in human and rat GALR. The sequence of one of the subcloned PCR products revealed homology to a sequence in the 3' region of the human CD22 gene following a BLAST search of GenBank's database. A search for open reading frames (ORF) in the non-coding CD22 sequence resulted in identification of two novel putative intronless genes, GPR40 and GPR41. The recent submission of sequence overlapping the downstream CD22 sequence revealed a possible polymorphic insert containing a third intronless gene, GPR42, sharing 98% amino acid identity with GPR41, followed by a fourth intronless gene, GPR43. Thus, the GPR40, GPR41, GPR42, and GPR43 genes, respectively, occur downstream from CD22, a gene previously localized on chromosome 19q13.1. The four putative novel human genes encode new members of the GPCR family and share little homology with GALR.

摘要

在我们寻找新型人类甘丙肽受体(GALR)亚型的过程中,基于人类和大鼠GALR的保守序列,使用简并引物对人类基因组DNA进行了PCR扩增。对其中一个亚克隆的PCR产物进行测序,经在GenBank数据库中进行BLAST搜索后,发现其与人类CD22基因3'区域的一个序列具有同源性。在非编码CD22序列中搜索开放阅读框(ORF),结果鉴定出两个新的假定无内含子基因,即GPR40和GPR41。最近提交的与CD22下游序列重叠的序列显示,存在一个可能的多态性插入片段,其中包含第三个无内含子基因GPR42,它与GPR41具有98%的氨基酸同一性,随后是第四个无内含子基因GPR43。因此,GPR40、GPR41、GPR42和GPR43基因分别位于CD22下游,CD22是一个先前定位在19q13.1染色体上的基因。这四个假定的新型人类基因编码GPCR家族的新成员,与GALR几乎没有同源性。

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