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PredAcc: prediction of solvent accessibility.

作者信息

Mucchielli-Giorgi M H, Hazout S, Tufféry P

机构信息

Equipe de Bioinformatique Moléculaire, INSERM U155, Université Paris 7, case 7113, 2, place Jussieu, 75251 Paris cedex 05, France.

出版信息

Bioinformatics. 1999 Feb;15(2):176-7. doi: 10.1093/bioinformatics/15.2.176.

DOI:10.1093/bioinformatics/15.2.176
PMID:10089205
Abstract

UNLABELLED

PredAcc is a tool for predicting the solvent accessibility of protein residues from the sequence at different relative accessibility levels (0-55%). The prediction rate varies between 70. 7% (for 25% relative accessibility) and 85.7% (for 0% relative accessibility). Amino acids are predicted in four categories: almost certainly hidden and almost certainly exposed with a given a posteriori prediction error, probably hidden and probably exposed otherwise.

AVAILABILITY

http://condor.urbb.jussieu.fr/PredAccCfg.html

CONTACT

tuffery@urbb.jussieu.fr

摘要

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