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犬20号染色体q15.1至q15.2区域两个紧密连锁基因(AMT、TCTA)的基因组结构与序列

Genomic structures and sequences of two closely linked genes (AMT, TCTA) on dog chromosome 20q15.1-->q15.2.

作者信息

Leeb T, Breen M, Brenig B

机构信息

Institute of Veterinary Medicine, University of Göttingen, Göttingen, Germany.

出版信息

Cytogenet Cell Genet. 2000;89(1-2):98-100. doi: 10.1159/000015573.

DOI:10.1159/000015573
PMID:10894947
Abstract

Analysis of genomic sequence from canine chromosome 20q15.1-->q15.2 revealed the presence of two closely linked genes. The two genes represent the corresponding canine orthologs of human aminomethyltransferase (AMT) and the human T-cell leukemia translocation associated (TCTA) gene. Aminomethyltransferase or glycine cleavage system T-protein is an important enzyme in glycine metabolism. The reported canine AMT gene spans 5 kb and consists of nine exons. It encodes a protein of 403 amino acids with 88% identity to human aminomethyltransferase. Human TCTA is located on 3p21 near the breakpoint of a t(1;3) translocation observed in some cancer cell lines. The 4-kb canine TCTA gene consists of three exons and probably represents a pseudogene. It is located adjacent to AMT and very close to DAG1 and BSN.

摘要

对犬类20号染色体q15.1至q15.2区域的基因组序列分析显示存在两个紧密连锁的基因。这两个基因分别代表人类氨基甲基转移酶(AMT)和人类T细胞白血病易位相关(TCTA)基因的相应犬类直系同源基因。氨基甲基转移酶或甘氨酸裂解系统T蛋白是甘氨酸代谢中的一种重要酶。报道的犬类AMT基因跨度为5kb,由九个外显子组成。它编码一种403个氨基酸的蛋白质,与人类氨基甲基转移酶的同源性为88%。人类TCTA位于3p21,靠近在一些癌细胞系中观察到的t(1;3)易位的断点。4kb的犬类TCTA基因由三个外显子组成,可能代表一个假基因。它位于AMT附近,与DAG1和BSN非常接近。

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