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抗体 - 抗原结合的定量计算:采用线性相互作用能方法计算类固醇 - DB3 的结合能

Quantitative calculations of antibody--antigen binding: steroid--DB3 binding energies by the linear interaction energy method.

作者信息

Chen J, Wang R, Taussig M, Houk K N

机构信息

Department of Chemistry and Biochemistry, University of California, Los Angeles, California 90095-1569, USA.

出版信息

J Org Chem. 2001 May 4;66(9):3021-6. doi: 10.1021/jo001619m.

DOI:10.1021/jo001619m
PMID:11325266
Abstract

Linear interaction energy/molecular dynamics calculations have been used to compute steroid/antibody binding energies. The absolute binding affinities of 10 steroids to antibody DB3 and of a hapten to catalytic antibody 1E9 are computed and compared to experiment. A detailed analysis of the molecular origins of the observed binding patterns is provided. The binding energy of an untested steroid is predicted.

摘要

线性相互作用能/分子动力学计算已被用于计算类固醇/抗体结合能。计算了10种类固醇与抗体DB3以及一种半抗原与催化抗体1E9的绝对结合亲和力,并与实验结果进行了比较。对观察到的结合模式的分子起源进行了详细分析。预测了一种未测试类固醇的结合能。

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