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ENDscript:一个展示序列和结构信息的工作流程。

ENDscript: a workflow to display sequence and structure information.

作者信息

Gouet Patrice, Courcelle Emmanuel

机构信息

Laboratoire de Bio-Cristallographie, IBCP-CNRS UMR 5086, 7 passage du Vercors, 69367 Lyon Cedex 07, France.

出版信息

Bioinformatics. 2002 May;18(5):767-8. doi: 10.1093/bioinformatics/18.5.767.

Abstract

UNLABELLED

ENDscript is a web server grouping popular programs such as BLAST, Multalin and DSSP. It uses as query the co-ordinates file of a protein in Protein Data Bank format and generates PostScript and png figures showing: residues conserved after a multiple alignment against homologous sequences, secondary structure elements, accessibility, hydropathy and intermolecular contacts. Thus, the user can relate quickly 1D, 2D and 3D information of a protein of known structure.

AVAILABILITY

http://genopole.toulouse.inra.fr/ENDscript

摘要

未标记

ENDscript是一个网络服务器,它整合了诸如BLAST、Multalin和DSSP等常用程序。它以蛋白质数据库格式的蛋白质坐标文件作为查询对象,并生成PostScript和png图形,展示:与同源序列进行多序列比对后保守的残基、二级结构元件、可及性、亲水性和分子间接触。因此,用户可以快速关联已知结构蛋白质的一维、二维和三维信息。

可用性

http://genopole.toulouse.inra.fr/ENDscript

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