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美国国家癌症研究所/信息技术中心微阵列数据库(mAdb)系统——用于管理和分析Affymetrix芯片及点阵式基因表达微阵列的生物信息学工具。

The NCI/CIT microArray database (mAdb) system - bioinformatics for the management and analysis of Affymetrix and spotted gene expression microarrays.

作者信息

Greene J M, Asaki E, Bian X, Bock C, Castillo S, Chandramouli G, Martell R, Meyer K, Ruppert T, Sundaram S, Tomlin J, Yang L, Powell J

机构信息

SRA International, Inc.

出版信息

AMIA Annu Symp Proc. 2003;2003:1066.

Abstract

A scalable, modular, enterprise-level system for both microarray databasing and analysis over the Internet has been developed over the past four years by the National Cancer Institute's Center for Cancer Research in collaboration with NIH's Center for Information Technology. This completely Web-based system, called mAdb (for microArray database), is currently supporting over 810 registered users and collaborators at NIH and contains over 22,000 microarray experiments, making it one of the largest collections of microarray data in existence. In addition, the mAdb system has been ported for the Netherlands Cancer Institute, the Genome Institute of Singapore, and the CDC. This system has been used for a wide variety of scientific experiments spanning the range from cancer to studies of early development, and for human, mouse, rat, yeast, and numerous microbial organisms.

摘要

在过去四年里,美国国家癌症研究所癌症研究中心与美国国立卫生研究院信息技术中心合作,开发了一个可扩展的、模块化的企业级系统,用于在互联网上进行微阵列数据库管理和分析。这个完全基于网络的系统称为mAdb(微阵列数据库),目前为美国国立卫生研究院的810多名注册用户和合作者提供支持,包含超过22000个微阵列实验,使其成为现存最大的微阵列数据集之一。此外,mAdb系统已移植到荷兰癌症研究所、新加坡基因组研究所和疾病控制与预防中心。该系统已用于从癌症到早期发育研究等广泛的科学实验,以及用于人类、小鼠、大鼠、酵母和众多微生物。

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