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肠道病原体资源整合中心(ERIC):为与生物防御相关的肠道细菌研究提供生物信息学支持。

Enteropathogen Resource Integration Center (ERIC): bioinformatics support for research on biodefense-relevant enterobacteria.

作者信息

Glasner Jeremy D, Plunkett Guy, Anderson Bradley D, Baumler David J, Biehl Bryan S, Burland Valerie, Cabot Eric L, Darling Aaron E, Mau Bob, Neeno-Eckwall Eric C, Pot David, Qiu Yu, Rissman Anna I, Worzella Sara, Zaremba Sam, Fedorko Joel, Hampton Tom, Liss Paul, Rusch Michael, Shaker Matthew, Shaull Lorie, Shetty Panna, Thotakura Silpa, Whitmore Jon, Blattner Frederick R, Greene John M, Perna Nicole T

机构信息

Genome Center, University of Wisconsin, 425G Henry Mall, Madison, Madison, WI 53703, USA.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2008 Jan;36(Database issue):D519-23. doi: 10.1093/nar/gkm973. Epub 2007 Nov 13.

DOI:10.1093/nar/gkm973
PMID:17999997
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2238966/
Abstract

ERIC, the Enteropathogen Resource Integration Center (www.ericbrc.org), is a new web portal serving as a rich source of information about enterobacteria on the NIAID established list of Select Agents related to biodefense-diarrheagenic Escherichia coli, Shigella spp., Salmonella spp., Yersinia enterocolitica and Yersinia pestis. More than 30 genomes have been completely sequenced, many more exist in draft form and additional projects are underway. These organisms are increasingly the focus of studies using high-throughput experimental technologies and computational approaches. This wealth of data provides unprecedented opportunities for understanding the workings of basic biological systems and discovery of novel targets for development of vaccines, diagnostics and therapeutics. ERIC brings information together from disparate sources and supports data comparison across different organisms, analysis of varying data types and visualization of analyses in human and computer-readable formats.

摘要

肠道病原体资源整合中心(ERIC,网址:www.ericbrc.org)是一个新的网络门户,是有关美国国立过敏和传染病研究所(NIAID)确定的与生物防御相关的特定病原体清单上的肠道杆菌(致泻性大肠杆菌、志贺氏菌属、沙门氏菌属、小肠结肠炎耶尔森氏菌和鼠疫耶尔森氏菌)的丰富信息来源。已有30多个基因组完成了全序列测定,还有更多基因组处于草图形式,并且正在开展其他项目。这些生物体越来越成为使用高通量实验技术和计算方法进行研究的重点。这些丰富的数据为理解基本生物系统的运作以及发现疫苗、诊断方法和治疗方法开发的新靶点提供了前所未有的机会。ERIC将来自不同来源的信息整合在一起,并支持跨不同生物体的数据比较、不同数据类型的分析以及以人类可读和计算机可读格式进行分析可视化。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8017/2238966/8ac8bdb7cadf/gkm973f1.jpg
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