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MAP-O-MAT:基于互联网的连锁图谱构建

MAP-O-MAT: internet-based linkage mapping.

作者信息

Kong X, Matise T C

机构信息

Department of Genetics, Rutgers University Piscataway NJ 08854, USA.

出版信息

Bioinformatics. 2005 Feb 15;21(4):557-9. doi: 10.1093/bioinformatics/bti024. Epub 2004 Sep 16.

Abstract

UNLABELLED

MAP-O-MAT is a web-based server for automated linkage mapping of human polymorphic DNA markers. MAP-O-MAT facilitates the verification of order and map distances for custom mapping sets using genotype data from the CEPH database, and from the Marshfield, SNP Consortium and Rutgers linkage maps (exclusive to the deCODE genotyping data). The CRI-MAP program is used for likelihood calculations and some mapping algorithms, and physical map positions are provided from the human genome assembly.

AVAILABILITY

MAP-O-MAT is located at http://compgen.rutgers.edu/mapomat/

CONTACT

matise@biology.rutgers.edu.

摘要

未标记

MAP - O - MAT是一个基于网络的服务器,用于人类多态性DNA标记的自动连锁图谱构建。MAP - O - MAT利用来自CEPH数据库以及马什菲尔德、SNP联盟和罗格斯连锁图谱(不包括deCODE基因分型数据)的基因型数据,便于验证定制图谱集的顺序和图谱距离。CRI - MAP程序用于似然性计算和一些图谱构建算法,并从人类基因组组装中提供物理图谱位置。

可用性

MAP - O - MAT位于http://compgen.rutgers.edu/mapomat/

联系方式

matise@biology.rutgers.edu

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