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ProfDist:一种基于轮廓距离构建大型系统发育树的工具。

ProfDist: a tool for the construction of large phylogenetic trees based on profile distances.

作者信息

Friedrich Joachim, Dandekar Thomas, Wolf Matthias, Müller Tobias

机构信息

Department of Bioinformatics, Biocenter, University of Würzburg, Germany.

出版信息

Bioinformatics. 2005 May 1;21(9):2108-9. doi: 10.1093/bioinformatics/bti289. Epub 2005 Jan 27.

Abstract

SUMMARY

ProfDist is a user-friendly software package using the profile-neighbor-joining method (PNJ) in inferring phylogenies based on profile distances on DNA or RNA sequences. It is a tool for reconstructing and visualizing large phylogenetic trees providing new and standard features with a special focus on time efficency, robustness and accuracy.

AVAILABILITY

A Windows version of ProfDist comes with a graphical user interface and is freely available at http://profdist.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de

摘要

摘要

ProfDist是一个用户友好的软件包,它使用profile邻接法(PNJ),基于DNA或RNA序列的profile距离来推断系统发育。它是一个用于重建和可视化大型系统发育树的工具,提供了新的标准功能,特别注重时间效率、稳健性和准确性。

可用性

ProfDist的Windows版本配有图形用户界面,可从http://profdist.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de免费获取。

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