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cluML:一种用于微阵列数据聚类及聚类有效性评估的标记语言。

cluML: A markup language for clustering and cluster validity assessment of microarray data.

作者信息

Bolshakova Nadia, Cunningham Pádraig

机构信息

Department of Computer Science, Trinity College, Dublin, Ireland.

出版信息

Appl Bioinformatics. 2005;4(3):211-3. doi: 10.2165/00822942-200504030-00006.

DOI:10.2165/00822942-200504030-00006
PMID:16231963
Abstract

cluML is a new markup language for microarray data clustering and cluster validity assessment. The XML-based format has been designed to address some of the limitations observed in traditional formats, such as inability to store multiple clustering (including biclustering) and validation results within a dataset. cluML is an effective tool to support biomedical knowledge representation in gene expression data analysis. Although cluML was developed for DNA microarray analysis applications, it can be effectively used for the representation of clustering and for the validation of other biomedical and physical data that has no limitations.

摘要

cluML是一种用于微阵列数据聚类和聚类有效性评估的新标记语言。基于XML的格式旨在解决传统格式中存在的一些局限性,比如无法在一个数据集中存储多个聚类(包括双聚类)和验证结果。cluML是在基因表达数据分析中支持生物医学知识表示的有效工具。尽管cluML是为DNA微阵列分析应用而开发的,但它可有效地用于聚类表示以及对无限制的其他生物医学和物理数据的验证。

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