• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

F-spondin的第一个和第四个TSR结构域的溶液结构

Solution structures of the first and fourth TSR domains of F-spondin.

作者信息

Pääkkönen Kimmo, Tossavainen Helena, Permi Perttu, Rakkolainen Harri, Rauvala Heikki, Raulo Erkki, Kilpeläinen Ilkka, Güntert Peter

机构信息

Tatsuo Miyazawa Memorial Program, RIKEN Genomic Sciences Center, Yokohama, Japan.

出版信息

Proteins. 2006 Aug 15;64(3):665-72. doi: 10.1002/prot.21030.

DOI:10.1002/prot.21030
PMID:16736493
Abstract

F-spondin is a protein mainly associated with neuronal development. It attaches to the extracellular matrix and acts in the axon guidance of the developing nervous system. F-spondin consists of eight domains, six of which are TSR domains. The TSR domain family binds a wide range of targets. Here we present the NMR solution structures of TSR1 and TSR4. TSR domains have an unusual fold that is characterized by a long, nonglobular shape, consisting of two beta-strands and one irregular extended strand. Three disulfide bridges and stack of alternating tryptophan and arginine side-chains stabilize the structure. TSR1 and TSR4 structures are similar to each other and to the previously determined TSR domain X-ray structures from another protein, TSP, although TSR4 exhibits a mobile loop not seen in other structures.

摘要

F-spondin是一种主要与神经元发育相关的蛋白质。它附着于细胞外基质,并在发育中的神经系统的轴突导向中发挥作用。F-spondin由八个结构域组成,其中六个是TSR结构域。TSR结构域家族能结合多种靶标。在此我们展示了TSR1和TSR4的核磁共振溶液结构。TSR结构域具有一种不寻常的折叠方式,其特点是呈长的、非球状形状,由两条β链和一条不规则的延伸链组成。三个二硫键以及交替排列的色氨酸和精氨酸侧链的堆叠稳定了该结构。TSR1和TSR4的结构彼此相似,且与先前从另一种蛋白质TSP确定的TSR结构域X射线结构相似,尽管TSR4呈现出一个在其他结构中未见的可移动环。

相似文献

1
Solution structures of the first and fourth TSR domains of F-spondin.F-spondin的第一个和第四个TSR结构域的溶液结构
Proteins. 2006 Aug 15;64(3):665-72. doi: 10.1002/prot.21030.
2
The neuronal class 2 TSR proteins F-spondin and Mindin: a small family with divergent biological activities.神经元2类TSR蛋白F-spondin和Mindin:一个具有不同生物学活性的小家族。
Int J Biochem Cell Biol. 2004 Jun;36(6):975-80. doi: 10.1016/j.biocel.2004.01.002.
3
The structure of the Ca²+-binding, glycosylated F-spondin domain of F-spondin - A C2-domain variant in an extracellular matrix protein.F-spondin的Ca²⁺结合糖基化F-spondin结构域的结构——一种细胞外基质蛋白中的C2结构域变体
BMC Struct Biol. 2011 May 10;11:22. doi: 10.1186/1472-6807-11-22.
4
The layered fold of the TSR domain of P. falciparum TRAP contains a heparin binding site.恶性疟原虫TRAP的TSR结构域的分层折叠包含一个肝素结合位点。
Protein Sci. 2006 Jul;15(7):1760-8. doi: 10.1110/ps.052068506.
5
Structure of the F-spondin reeler domain reveals a unique beta-sandwich fold with a deformable disulfide-bonded loop.F-spondin里勒结构域的结构揭示了一种独特的β-三明治折叠结构,带有一个可变形的二硫键连接环。
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2008 Nov;64(Pt 11):1138-45. doi: 10.1107/S0907444908028308. Epub 2008 Oct 18.
6
The dimeric and trimeric solution structures of the multidomain complement protein properdin by X-ray scattering, analytical ultracentrifugation and constrained modelling.通过X射线散射、分析型超速离心和受限建模得到的多结构域补体蛋白备解素的二聚体和三聚体溶液结构。
J Mol Biol. 2004 Nov 5;343(5):1327-43. doi: 10.1016/j.jmb.2004.09.001.
7
The complex multidomain organization of SCO-spondin protein is highly conserved in mammals.SCO-spondin蛋白复杂的多结构域组织在哺乳动物中高度保守。
Brain Res Rev. 2007 Feb;53(2):321-7. doi: 10.1016/j.brainresrev.2006.09.007. Epub 2006 Nov 27.
8
Crystal structure of the TSP-1 type 1 repeats: a novel layered fold and its biological implication.血小板反应蛋白-1第1型重复序列的晶体结构:一种新型的层状折叠及其生物学意义。
J Cell Biol. 2002 Oct 28;159(2):373-82. doi: 10.1083/jcb.200206062. Epub 2002 Oct 21.
9
Structure of the F-spondin domain of mindin, an integrin ligand and pattern recognition molecule.整合素配体及模式识别分子mindin的F-spondin结构域结构
EMBO J. 2009 Feb 4;28(3):286-97. doi: 10.1038/emboj.2008.288. Epub 2009 Jan 15.
10
Solution structure of the RIM1alpha PDZ domain in complex with an ELKS1b C-terminal peptide.与ELKS1b C末端肽复合的RIM1α PDZ结构域的溶液结构。
J Mol Biol. 2005 Sep 16;352(2):455-66. doi: 10.1016/j.jmb.2005.07.047.

引用本文的文献

1
The Energetic Origins of Pi-Pi Contacts in Proteins.蛋白质中π-π相互作用的能量起源
J Am Chem Soc. 2023 Nov 2;145(45):24836-51. doi: 10.1021/jacs.3c09198.
2
Structural insights into MIC2 recognition by MIC2-associated protein in Toxoplasma gondii.弓形虫中 MIC2 相关蛋白识别 MIC2 的结构见解。
Commun Biol. 2023 Aug 31;6(1):895. doi: 10.1038/s42003-023-05277-0.
3
Synapse Formation and Function Across Species: Ancient Roles for CCP, CUB, and TSP-1 Structural Domains.跨物种的突触形成与功能:CCP、CUB和TSP-1结构域的古老作用
Front Neurosci. 2022 Apr 25;16:866444. doi: 10.3389/fnins.2022.866444. eCollection 2022.
4
Protein -Mannosylation and -Mannosyl Tryptophan in Chemical Biology and Medicine.蛋白质的甘露糖化和色氨酸的甘露糖化在化学生物学和医学中的应用。
Molecules. 2021 Aug 30;26(17):5258. doi: 10.3390/molecules26175258.
5
Configurational Entropy of Folded Proteins and Its Importance for Intrinsically Disordered Proteins.折叠蛋白质的构象熵及其对无序蛋白质的重要性。
Int J Mol Sci. 2021 Mar 26;22(7):3420. doi: 10.3390/ijms22073420.
6
Structure and function insights garnered from in silico modeling of the thrombospondin type-1 domain-containing 7A antigen.通过对血小板反应蛋白 1 型结构域包含蛋白 7A 抗原的计算机建模获得的结构与功能方面的认识。
Proteins. 2019 Feb;87(2):136-145. doi: 10.1002/prot.25640. Epub 2018 Dec 21.
7
The Most N-Terminal Region of THSD7A Is the Predominant Target for Autoimmunity in THSD7A-Associated Membranous Nephropathy.THSD7A 相关膜性肾病中自身免疫的主要靶抗原位于 THSD7A 的最 N 端区域。
J Am Soc Nephrol. 2018 May;29(5):1536-1548. doi: 10.1681/ASN.2017070805. Epub 2018 Mar 19.
8
Intrinsic disorder in spondins and some of their interacting partners.Spondin蛋白及其一些相互作用伴侣中的内在无序性。
Intrinsically Disord Proteins. 2016 Dec 15;4(1):e1255295. doi: 10.1080/21690707.2016.1255295. eCollection 2016.
9
Systematic evaluation of combined automated NOE assignment and structure calculation with CYANA.使用CYANA对自动NOE分配与结构计算相结合的系统评估。
J Biomol NMR. 2015 May;62(1):81-95. doi: 10.1007/s10858-015-9921-z. Epub 2015 Mar 22.
10
Prediction of peak overlap in NMR spectra.预测 NMR 光谱中的峰重叠。
J Biomol NMR. 2013 Jun;56(2):113-23. doi: 10.1007/s10858-013-9727-9. Epub 2013 Apr 13.