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U_A/ACU 凸起 RNA 双链体中配体 - 胞嘧啶复合物的特征荧光发射。

Emission of characteristic fluorescence from the ligand-cytosine complex in U_A/ACU bulged RNA duplex.

作者信息

Zhang Jinhua, Takei Fumie, Nakatani Kazuhiko

机构信息

Department of Regulatory Bioorganic Chemistry, The Institute of Scientific and Industrial Research (SANKEN), Osaka University, 8-1 Mihogaoka, Ibaraki 567-0047, Japan.

出版信息

Bioorg Med Chem. 2007 Jul 15;15(14):4813-7. doi: 10.1016/j.bmc.2007.05.007. Epub 2007 May 6.

DOI:10.1016/j.bmc.2007.05.007
PMID:17513115
Abstract

Here we show that N,N-bis(3-aminopropyl)-2,7-diamino-1,8-naphthyridine (DANP) binds to the single cytosine bulge in RNA duplexes. When the base pairs flanking the C-bulge were A-U base pairs, a characteristic fluorescence was emitted from the DANP-C-bulge complex. The fluorescence would be useful for detecting the C-bulge in RNA secondary structures.

摘要

在此我们表明，N,N-双(3-氨丙基)-2,7-二氨基-1,8-萘啶(DANP)与RNA双链体中的单胞嘧啶凸起结合。当C-凸起两侧的碱基对为A-U碱基对时，DANP-C-凸起复合物会发出特征性荧光。这种荧光将有助于检测RNA二级结构中的C-凸起。

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