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Duplicate ditag analysis in LongSAGE.

作者信息

Emmersen Jeppe

机构信息

Department of Biochemistry, Chemistry and Environmental Engineering, University of Aalborg, Aalborg, Denmark.

出版信息

Methods Mol Biol. 2008;387:143-50. doi: 10.1007/978-1-59745-454-4_11.

DOI:10.1007/978-1-59745-454-4_11
PMID:18287629
Abstract

The Long serial analysis of gene expression (SAGE) protocol generates ditags from tags with overlapping overhangs, thereby increasing the probability of duplicate ditag formation in LongSAGE. In this chapter, a tool is presented that facilitates the analysis of duplicate ditags in LongSAGE studies to determine whether they should be included or not.

摘要

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