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HIV-1蛋白酶耐药性突变I50L与在多种突变背景下对阿扎那韦耐药以及对其他蛋白酶抑制剂敏感相关。

The HIV-1 protease resistance mutation I50L is associated with resistance to atazanavir and susceptibility to other protease inhibitors in multiple mutational contexts.

作者信息

Sista P, Wasikowski B, Lecocq P, Pattery T, Bacheler L

机构信息

VircoLab Inc., Durham, NC 27713, USA.

出版信息

J Clin Virol. 2008 Aug;42(4):405-8. doi: 10.1016/j.jcv.2008.03.023. Epub 2008 May 12.

Abstract

BACKGROUND

The HIV-1 protease mutation I50 L causes atazanavir resistance but increases susceptibility to other PIs. Predicted phenotypic FC values were obtained from viral genotypes, using the virtual Phenotype-LM bioinformatics tool (powering vircoTYPE).

OBJECTIVE

To evaluate I50 L's effect on susceptibility to 8 PIs, in a large genotype database.

STUDY DESIGN

I50 L containing routine clinical isolate samples in Virco's genotype database were paired with samples having like patterns (or profiles) of IAS-USA-defined primary PI mutations, but lacking I50 L. Using vircoTYPE (version 4.1), the median predicted FC for each mutational profile was determined. I50 L-associated shifts in FC were evaluated using drug-specific CCOs.

RESULTS

We selected 307 and 37098 samples with and without I50 L. These corresponded to 31 mutation patterns of > or =3 samples each. I50 L caused resistance to atazanavir in all 31 mutation contexts, but was associated with higher susceptibility for other PIs. The largest I50 L-associated shifts in median predicted FC were: 1.2 to 42.4 (atazanavir), 10.2 to 3.2 (amprenavir), 3.3 to 0.5 (darunavir), 13 to 0.5 (indinavir), 34.9 to 1.3 (lopinavir), 22.3 to 1.3 (nelfinavir), 5.2 to 0.3 (saquinavir) and 29.9 to 5.2 (tipranavir).

CONCLUSIONS

The PI mutation I50 L causes clinically relevant resistance and increased susceptibility to atazanavir and other PIs respectively.

摘要

背景

HIV-1蛋白酶突变I50L会导致对阿扎那韦耐药,但会增加对其他蛋白酶抑制剂(PI)的敏感性。使用虚拟表型-LM生物信息学工具(为vircoTYPE提供支持)从病毒基因型中获取预测的表型折点(FC)值。

目的

在一个大型基因型数据库中评估I50L对8种PI敏感性的影响。

研究设计

将Virco基因型数据库中含有I50L的常规临床分离株样本与具有IAS-USA定义的原发性PI突变相似模式(或谱)但缺乏I50L的样本进行配对。使用vircoTYPE(4.1版)确定每个突变谱的中位预测FC。使用药物特异性折点变化(CCO)评估I50L相关的FC变化。

结果

我们选择了307个有I50L的样本和37098个没有I50L的样本。这些样本分别对应31种每种有≥3个样本的突变模式。在所有31种突变情况下,I50L都会导致对阿扎那韦耐药,但与对其他PI的更高敏感性相关。I50L相关的中位预测FC最大变化为:1.2至42.4(阿扎那韦)、10.2至3.2(安普那韦)、3.3至0.5(达芦那韦)、13至0.5(茚地那韦)、34.9至1.3(洛匹那韦)、22.3至1.3(奈非那韦)、5.2至0.3(沙奎那韦)和29.9至5.2(替拉那韦)。

结论

PI突变I50L分别导致临床相关耐药以及对阿扎那韦和其他PI的敏感性增加。

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