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qpcR:用于定量实时聚合酶链反应分析中S形模型选择的R软件包。

qpcR: an R package for sigmoidal model selection in quantitative real-time polymerase chain reaction analysis.

作者信息

Ritz Christian, Spiess Andrej-Nikolai

机构信息

Statistics Group, Department of Natural Sciences, Faculty of Life Sciences, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark.

出版信息

Bioinformatics. 2008 Jul 1;24(13):1549-51. doi: 10.1093/bioinformatics/btn227. Epub 2008 May 14.

Abstract

UNLABELLED

The qpcR library is an add-on to the free R statistical environment performing sigmoidal model selection in real-time quantitative polymerase chain reaction (PCR) data analysis. Additionally, the package implements the most commonly used algorithms for real-time PCR data analysis and is capable of extensive statistical comparison for the selection and evaluation of the different models based on several measures of goodness of fit.

AVAILABILITY

www.dr-spiess.de/qpcR.html.

SUPPLEMENTARY INFORMATION

Statistical evaluations of the implemented methods can be found at www.dr-spiess.de under 'Supplemental Data'.

摘要

未标注

qpcR库是免费的R统计环境的一个附加组件,用于在实时定量聚合酶链反应(PCR)数据分析中进行S形模型选择。此外,该软件包还实现了实时PCR数据分析中最常用的算法,并且能够基于几种拟合优度度量对不同模型进行广泛的统计比较,以进行选择和评估。

可用性

www.dr-spiess.de/qpcR.html。

补充信息

已实施方法的统计评估可在www.dr-spiess.de的“补充数据”下找到。

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