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蛋白质组学的数据标准和受控词汇表。

Data standards and controlled vocabularies for proteomics.

作者信息

Martens Lennart, Palazzi Luisa Montecchi, Hermjakob Henning

机构信息

European Bioinformatics Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge, UK.

出版信息

Methods Mol Biol. 2008;484:279-86. doi: 10.1007/978-1-59745-398-1_18.

DOI:10.1007/978-1-59745-398-1_18
PMID:18592186
Abstract

Proteomics data can be diverse and complex, and are typically produced on a large scale. To allow sharing and centralized storage and dissemination of such results, the Human Proteome Organization (HUPO) Proteomics Standards Initiative (PSI) has created a set of community standards for the exchange of mass spectrometry and protein interaction data. We describe the origins and overall concepts behind these standards, as well as the individual efforts that are ongoing in the field of mass spectrometry proteomics and protein interactions.

摘要

蛋白质组学数据可能多种多样且复杂,并且通常是大规模产生的。为了实现此类结果的共享、集中存储和传播,人类蛋白质组组织(HUPO)蛋白质组学标准倡议(PSI)制定了一套用于质谱和蛋白质相互作用数据交换的社区标准。我们描述了这些标准背后的起源和总体概念,以及质谱蛋白质组学和蛋白质相互作用领域正在进行的各项工作。

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