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通过点击化学将氮氧化物自旋标记位点特异性插入DNA探针,用于电子双共振(ELDOR)光谱结构分析。

Site-specific insertion of nitroxide-spin labels into DNA probes by click chemistry for structural analyses by ELDOR spectroscopy.

作者信息

Flaender M, Sicoli G, Fontecave Th, Mathis G, Saint-Pierre C, Boulard Y, Gambarelli S, Gasparutto D

机构信息

Laboratoire des Lésions des Acides Nucléiques, SCIB/UMR E3 CEA-UJF, INAC, CEA-Grenoble, F-38054 Grenoble Cedex 9, France.

出版信息

Nucleic Acids Symp Ser (Oxf). 2008(52):147-8. doi: 10.1093/nass/nrn075.

DOI:10.1093/nass/nrn075
PMID:18776296
Abstract

A new approach is described for the insertion of nitroxide spin-labels at specific positions within DNA oligomers. The latter bioconjugaison strategy is based on a click chemistry 1,3-dipolar cycloaddition between a spin-labeling reagent, namely the 4-azido-TEMPO, and alkyne modified uridine-containing oligonucleotides. This highly efficient labeling method was applied for site-specific incorporation of two TEMPO units within a set of double-stranded DNA constructs. Then the determination of the inter-nitroxide distances was achieved by using a four-pulses DEER technique that successfully validates the new site-directed spin labeling strategy.

摘要

本文描述了一种在DNA寡聚物特定位置插入氮氧化物自旋标记的新方法。后一种生物共轭策略基于自旋标记试剂(即4-叠氮基-TEMPO)与炔烃修饰的含尿苷寡核苷酸之间的点击化学1,3-偶极环加成反应。这种高效的标记方法被用于在一组双链DNA构建体中位点特异性地掺入两个TEMPO单元。然后,通过使用四脉冲双电子-电子共振(DEER)技术测定氮氧化物之间的距离,该技术成功验证了新的位点定向自旋标记策略。

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