• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

使用分选酶介导的蛋白质连接方法连接一个核磁共振不可见的溶解度增强标签。

Attachment of an NMR-invisible solubility enhancement tag using a sortase-mediated protein ligation method.

作者信息

Kobashigawa Yoshihiro, Kumeta Hiroyuki, Ogura Kenji, Inagaki Fuyuhiko

机构信息

Department of Structural Biology, Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Hokkaido University, Sapporo, Hokkaido, 060-0810, Japan.

出版信息

J Biomol NMR. 2009 Mar;43(3):145-50. doi: 10.1007/s10858-008-9296-5. Epub 2009 Jan 13.

DOI:10.1007/s10858-008-9296-5
PMID:19140010
Abstract

Sample solubility is essential for structural studies of proteins by solution NMR. Attachment of a solubility enhancement tag, such as GB1, MBP and thioredoxin, to a target protein has been used for this purpose. However, signal overlap of the tag with the target protein often made the spectral analysis difficult. Here we report a sortase-mediated protein ligation method to eliminate NMR signals arising from the tag by preparing the isotopically labeled target protein attached with the non-labeled GB1 tag at the C-terminus.

摘要

样品溶解度对于通过溶液核磁共振进行蛋白质结构研究至关重要。为此,人们已将诸如GB1、麦芽糖结合蛋白(MBP)和硫氧还蛋白等溶解度增强标签连接到目标蛋白上。然而,标签与目标蛋白的信号重叠常常使光谱分析变得困难。在此,我们报告一种分选酶介导的蛋白质连接方法,通过制备在C端连接有未标记GB1标签的同位素标记目标蛋白,来消除标签产生的核磁共振信号。

相似文献

1
Attachment of an NMR-invisible solubility enhancement tag using a sortase-mediated protein ligation method.使用分选酶介导的蛋白质连接方法连接一个核磁共振不可见的溶解度增强标签。
J Biomol NMR. 2009 Mar;43(3):145-50. doi: 10.1007/s10858-008-9296-5. Epub 2009 Jan 13.
2
Observing selected domains in multi-domain proteins via sortase-mediated ligation and NMR spectroscopy.通过 sortase 介导的连接和 NMR 光谱学观察多结构域蛋白中的选定结构域。
J Biomol NMR. 2011 Jan;49(1):3-7. doi: 10.1007/s10858-010-9464-2. Epub 2010 Dec 29.
3
Rapid addition of unlabeled silent solubility tags to proteins using a new substrate-fused sortase reagent.使用新型底物融合分选酶试剂将未标记的沉默溶解性标签快速添加到蛋白质中。
J Biomol NMR. 2016 Mar;64(3):197-205. doi: 10.1007/s10858-016-0019-z. Epub 2016 Feb 6.
4
Segmental isotope labeling of proteins for NMR structural study using a protein S tag for higher expression and solubility.使用蛋白 S 标签进行蛋白质的分段同位素标记,以实现更高的表达量和可溶性,用于 NMR 结构研究。
J Biomol NMR. 2012 Apr;52(4):303-13. doi: 10.1007/s10858-012-9610-0. Epub 2012 Mar 3.
5
A new vector coupling ligation-independent cloning with sortase a fusion for efficient cloning and one-step purification of tag-free recombinant proteins.一种新型载体,其将不依赖连接的克隆与分选酶A融合,用于高效克隆和无标签重组蛋白的一步纯化。
Protein Expr Purif. 2019 Sep;161:1-7. doi: 10.1016/j.pep.2019.04.004. Epub 2019 Apr 22.
6
Flow-based enzymatic ligation by sortase A.基于 sortase A 的流式酶连接。
Angew Chem Int Ed Engl. 2014 Aug 25;53(35):9203-8. doi: 10.1002/anie.201403582. Epub 2014 Jul 2.
7
Efficient Sortase-Mediated Ligation Using a Common C-Terminal Fusion Tag.使用常见C端融合标签的高效分选酶介导连接
Bioconjug Chem. 2020 May 20;31(5):1463-1473. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.0c00156. Epub 2020 Apr 23.
8
Efficient sortase-mediated N-terminal labeling of TEV protease cleaved recombinant proteins.高效分选酶介导的烟草蚀纹病毒蛋白酶切割重组蛋白的N端标记
Anal Biochem. 2017 Mar 15;521:55-58. doi: 10.1016/j.ab.2017.01.008. Epub 2017 Jan 11.
9
Sortase-mediated ligations for the site-specific modification of proteins.基于 sortase 的蛋白定点连接技术用于蛋白的定点修饰。
Curr Opin Chem Biol. 2014 Oct;22:122-8. doi: 10.1016/j.cbpa.2014.09.020. Epub 2014 Oct 6.
10
Sortase-mediated ligation: a gift from Gram-positive bacteria to protein engineering.分选酶介导的连接:革兰氏阳性菌给蛋白质工程的一份礼物。
Chembiochem. 2009 Mar 23;10(5):787-98. doi: 10.1002/cbic.200800724.

引用本文的文献

1
Isoform-specific C-terminal phosphorylation drives autoinhibition of Casein kinase 1.异构体特异性的C末端磷酸化驱动酪蛋白激酶1的自抑制。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Oct 8;121(41):e2415567121. doi: 10.1073/pnas.2415567121. Epub 2024 Oct 2.
2
Isoform-specific C-terminal phosphorylation drives autoinhibition of Casein Kinase 1.异构体特异性的C末端磷酸化驱动酪蛋白激酶1的自抑制。
bioRxiv. 2024 Jul 29:2023.04.24.538174. doi: 10.1101/2023.04.24.538174.
3
Conformational Distribution of a Multidomain Protein Measured by Single-Pair Small-Angle X-ray Scattering.

本文引用的文献

1
Overexpression of post-translationally modified peptides in Escherichia coli by co-expression with modifying enzymes.通过与修饰酶共表达在大肠杆菌中过表达翻译后修饰的肽段。
Protein Expr Purif. 2008 Feb;57(2):108-15. doi: 10.1016/j.pep.2007.10.018. Epub 2007 Nov 1.
2
A disease state mutation unfolds the parkin ubiquitin-like domain.疾病状态突变使帕金泛素样结构域展开。
Biochemistry. 2007 Dec 11;46(49):14162-9. doi: 10.1021/bi7016969. Epub 2007 Nov 16.
3
An efficient method for protein phosphorylation using the artificially introduced of cognate-binding modules into kinases and substrates.
通过单对小角 X 射线散射测量的多结构域蛋白质的构象分布。
J Phys Chem Lett. 2024 Jan 25;15(3):744-750. doi: 10.1021/acs.jpclett.3c02600. Epub 2024 Jan 14.
4
Fuzzy interactions between the auto-phosphorylated C-terminus and the kinase domain of CK1δ inhibits activation of TAp63α.CK1δ 自身磷酸化的 C 末端与激酶结构域之间的模糊相互作用抑制了 TAp63α 的激活。
Sci Rep. 2023 Sep 30;13(1):16423. doi: 10.1038/s41598-023-43515-x.
5
Chemical and Enzymatic Methods for Post-Translational Protein-Protein Conjugation.化学和酶法用于翻译后蛋白质-蛋白质偶联。
J Am Chem Soc. 2022 Aug 17;144(32):14404-14419. doi: 10.1021/jacs.2c00129. Epub 2022 Jul 31.
6
Convenient Auto-Processing Vector Based on Bamboo Mosaic Virus for Presentation of Antigens Through Enzymatic Coupling.基于竹嵌纹病毒的方便自动处理载体,通过酶偶联呈现抗原。
Front Immunol. 2021 Oct 14;12:739837. doi: 10.3389/fimmu.2021.739837. eCollection 2021.
7
Sortase-mediated segmental labeling: A method for segmental assignment of intrinsically disordered regions in proteins.Sortase 介导的分段标记:一种用于蛋白质中固有无序区域分段分配的方法。
PLoS One. 2021 Oct 28;16(10):e0258531. doi: 10.1371/journal.pone.0258531. eCollection 2021.
8
Segmental and site-specific isotope labelling strategies for structural analysis of posttranslationally modified proteins.用于翻译后修饰蛋白质结构分析的片段和位点特异性同位素标记策略。
RSC Chem Biol. 2021 Aug 11;2(5):1441-1461. doi: 10.1039/d1cb00045d. eCollection 2021 Oct 7.
9
Conformational dynamics of a multidomain protein by neutron scattering and computational analysis.通过中子散射和计算分析研究多结构域蛋白质的构象动力学。
Biophys J. 2021 Aug 17;120(16):3341-3354. doi: 10.1016/j.bpj.2021.07.001. Epub 2021 Jul 7.
10
Conformational ensemble of a multidomain protein explored by Gd electron paramagnetic resonance.通过钆电子顺磁共振研究多结构域蛋白质的构象集合。
Biophys J. 2021 Aug 3;120(15):2943-2951. doi: 10.1016/j.bpj.2021.06.033. Epub 2021 Jul 7.
一种通过将同源结合模块人工引入激酶和底物来进行蛋白质磷酸化的有效方法。
J Biotechnol. 2007 Sep 30;131(4):458-65. doi: 10.1016/j.jbiotec.2007.07.956. Epub 2007 Aug 14.
4
Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.人类癌症相关信号衔接蛋白CRK转化活性的结构基础
Nat Struct Mol Biol. 2007 Jun;14(6):503-10. doi: 10.1038/nsmb1241. Epub 2007 May 21.
5
Solution structure of the ubiquitin-associated domain of human BMSC-UbP and its complex with ubiquitin.人骨髓间充质干细胞泛素结合蛋白(BMSC-UbP)泛素相关结构域的溶液结构及其与泛素的复合物结构
Protein Sci. 2006 Jun;15(6):1248-59. doi: 10.1110/ps.051995006.
6
Protein ligation: an enabling technology for the biophysical analysis of proteins.蛋白质连接:一种用于蛋白质生物物理分析的支撑技术。
Nat Methods. 2006 Jun;3(6):429-38. doi: 10.1038/nmeth886.
7
Intein-based biosynthetic incorporation of unlabeled protein tags into isotopically labeled proteins for NMR studies.基于内含肽的未标记蛋白质标签在同位素标记蛋白质中的生物合成掺入用于核磁共振研究。
Nat Biotechnol. 2005 Jun;23(6):736-40. doi: 10.1038/nbt1097. Epub 2005 May 22.
8
Sortase-mediated protein ligation: a new method for protein engineering.分选酶介导的蛋白质连接:一种蛋白质工程的新方法。
J Am Chem Soc. 2004 Mar 10;126(9):2670-1. doi: 10.1021/ja039915e.
9
Synthesis of adenoviral targeting molecules by intein-mediated protein ligation.通过内含肽介导的蛋白质连接合成腺病毒靶向分子。
Gene Ther. 2003 Aug;10(16):1362-9. doi: 10.1038/sj.gt.3301989.
10
Autoregulation of a bacterial sigma factor explored by using segmental isotopic labeling and NMR.利用片段同位素标记和核磁共振技术对细菌σ因子的自动调节进行研究。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Jun 25;99(13):8536-41. doi: 10.1073/pnas.132033899.