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组合空间的复杂网络分析:NK景观案例

Complex-network analysis of combinatorial spaces: the NK landscape case.

作者信息

Tomassini Marco, Vérel Sébastien, Ochoa Gabriela

机构信息

Information Systems Institute, HEC, University of Lausanne, Switzerland.

出版信息

Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys. 2008 Dec;78(6 Pt 2):066114. doi: 10.1103/PhysRevE.78.066114. Epub 2008 Dec 24.

DOI:10.1103/PhysRevE.78.066114
PMID:19256912
Abstract

We propose a network characterization of combinatorial fitness landscapes by adapting the notion of inherent networks proposed for energy surfaces. We use the well-known family of NK landscapes as an example. In our case the inherent network is the graph whose vertices represent the local maxima in the landscape, and the edges account for the transition probabilities between their corresponding basins of attraction. We exhaustively extracted such networks on representative NK landscape instances, and performed a statistical characterization of their properties. We found that most of these network properties are related to the search difficulty on the underlying NK landscapes with varying values of K .

摘要

我们通过改编用于能量表面的固有网络概念,提出了一种组合适应度景观的网络表征方法。我们以著名的NK景观族为例。在我们的案例中,固有网络是这样一个图,其顶点代表景观中的局部最大值,边表示其相应吸引盆之间的转移概率。我们在具有代表性的NK景观实例上详尽地提取了此类网络,并对其属性进行了统计表征。我们发现,这些网络的大多数属性都与具有不同K值的基础NK景观上的搜索难度相关。

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Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys. 2008 Dec;78(6 Pt 2):066114. doi: 10.1103/PhysRevE.78.066114. Epub 2008 Dec 24.
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引用本文的文献

1
A Local Optima Network View of Real Function Fitness Landscapes.实函数适应度景观的局部最优网络视图。
Entropy (Basel). 2022 May 16;24(5):703. doi: 10.3390/e24050703.