Posada David
Departamento de Genética, Bioquímica e Inmunología, Facultad de Biología, Universidad de Vigo, Vigo, Spain.
Methods Mol Biol. 2009;537:93-112. doi: 10.1007/978-1-59745-251-9_5.
jModelTest is a bioinformatic tool for choosing among different models of nucleotide substitution. The program implements five different model selection strategies, including hierarchical and dynamical likelihood ratio tests (hLRT and dLRT), Akaike and Bayesian information criteria (AIC and BIC), and a performance-based decision theory method (DT). The output includes estimates of model selection uncertainty, parameter importance, and model-averaged parameter estimates, including model-averaged phylogenies. jModelTest is a Java program that runs under Mac OSX, Windows, and Unix systems with a Java Run Environment installed, and it can be freely downloaded from (http://darwin.uvigo.es).
jModelTest是一种用于在不同核苷酸替换模型中进行选择的生物信息学工具。该程序实现了五种不同的模型选择策略，包括层次和动态似然比检验（hLRT和dLRT）、赤池信息准则和贝叶斯信息准则（AIC和BIC），以及基于性能的决策理论方法（DT）。输出结果包括模型选择不确定性估计、参数重要性以及模型平均参数估计，其中包括模型平均系统发育树。jModelTest是一个Java程序，可在安装了Java运行环境的Mac OSX、Windows和Unix系统下运行，并且可以从（http://darwin.uvigo.es）免费下载。
