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Kohn-Sham 能量梯度的大规模多核并行化。

A massively multicore parallelization of the Kohn-Sham energy gradients.

机构信息

Centre for Computational Chemistry, School of Chemistry, University of Bristol, Bristol BS8 1TS, United Kingdom.

出版信息

J Comput Chem. 2010 Jul 30;31(10):2008-13. doi: 10.1002/jcc.21485.

DOI:10.1002/jcc.21485
PMID:20127716
Abstract

In a previous article [Brown et al., J Chem Theory Comput 2009, 4, 1620], we described a quadrature-based formulation of the Kohn-Sham Coulomb problem that allows for efficient parallelization over thousands of small processor cores. Here, we present the analytic gradients of this modified Kohn-Sham scheme, and describe the parallel implementation of the gradients on a numerical accelerator architecture. We demonstrate an order-of-magnitude acceleration for the combined energy and gradient calculation over a conventional single-core implementation.

摘要

在之前的一篇文章中[Brown 等人,J Chem Theory Comput 2009, 4, 1620],我们描述了一种基于求积的 Kohn-Sham 库仑问题公式,该公式允许在数千个小型处理器核心上进行高效的并行化。在这里,我们给出了这个修改后的 Kohn-Sham 方案的解析梯度,并描述了在数值加速器架构上对梯度进行并行实现。我们展示了在传统的单核实现上,组合能量和梯度计算的加速量级为一个数量级。

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