Suppr超能文献

Payao:一个用于 SBML 途径模型编纂的社区平台。

Payao: a community platform for SBML pathway model curation.

机构信息

The Systems Biology Institute, Tokyo, Japan.

出版信息

Bioinformatics. 2010 May 15;26(10):1381-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btq143. Epub 2010 Apr 5.

Abstract

SUMMARY

Payao is a community-based, collaborative web service platform for gene-regulatory and biochemical pathway model curation. The system combines Web 2.0 technologies and online model visualization functions to enable a collaborative community to annotate and curate biological models. Payao reads the models in Systems Biology Markup Language format, displays them with CellDesigner, a process diagram editor, which complies with the Systems Biology Graphical Notation, and provides an interface for model enrichment (adding tags and comments to the models) for the access-controlled community members.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

Freely available for model curation service at http://www.payaologue.org. Web site implemented in Seaser Framework 2.0 with S2Flex2, MySQL 5.0 and Tomcat 5.5, with all major browsers supported.

CONTACT

kitano@sbi.jp

摘要

摘要

Payao 是一个基于社区的协作型网络服务平台,用于基因调控和生化途径模型的编纂。该系统结合了 Web 2.0 技术和在线模型可视化功能,使协作社区能够对生物模型进行注释和编纂。Payao 以系统生物学标记语言格式读取模型,使用符合系统生物学图形符号的 CellDesigner 流程图编辑器显示模型,并为访问控制的社区成员提供模型丰富(向模型添加标签和注释)的接口。

可用性和实现

可在 http://www.payaologue.org 上免费获取模型编纂服务。该网站使用 Seaser Framework 2.0 实现,带有 S2Flex2、MySQL 5.0 和 Tomcat 5.5,支持所有主流浏览器。

联系信息

kitano@sbi.jp

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b47b/2865864/053343c1284a/btq143f1.jpg

文献AI研究员

20分钟写一篇综述,助力文献阅读效率提升50倍。

立即体验

用中文搜PubMed

大模型驱动的PubMed中文搜索引擎

马上搜索

文档翻译

学术文献翻译模型,支持多种主流文档格式。

立即体验