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圣:模型标注的轻量级集成环境。

Saint: a lightweight integration environment for model annotation.

机构信息

Centre for Integrated Systems Biology of Ageing and Nutrition, Newcastle University and School of Computing Science, Newcastle University, Newcastle Upon Tyne, UK.

出版信息

Bioinformatics. 2009 Nov 15;25(22):3026-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btp523. Epub 2009 Sep 4.

Abstract

UNLABELLED

Saint is a web application which provides a lightweight annotation integration environment for quantitative biological models. The system enables modellers to rapidly mark up models with biological information derived from a range of data sources.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

Saint is freely available for use on the web at http://www.cisban.ac.uk/saint. The web application is implemented in Google Web Toolkit and Tomcat, with all major browsers supported. The Java source code is freely available for download at http://saint-annotate.sourceforge.net. The Saint web server requires an installation of libSBML and has been tested on Linux (32-bit Ubuntu 8.10 and 9.04).

摘要

未加标签

Saint 是一个网络应用程序,它为定量生物模型提供了一个轻量级的注释集成环境。该系统使建模者能够快速地用从各种数据源获得的生物信息标记模型。

可用性和实现

Saint 可在网络上免费使用,网址为 http://www.cisban.ac.uk/saint。网络应用程序是用 Google Web Toolkit 和 Tomcat 实现的,支持所有主流浏览器。Java 源代码可在 http://saint-annotate.sourceforge.net 免费下载。Saint 网络服务器需要安装 libSBML,并且已经在 Linux(32 位 Ubuntu 8.10 和 9.04)上进行了测试。

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