• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

大规模蛋白质相互作用组学图谱绘制:策略与机遇。

Large-scale protein interactome mapping: strategies and opportunities.

机构信息

Department of Medical Protein Research, VIB, Albert Baertsoenkaai 3, 9000 Ghent, Belgium.

出版信息

Expert Rev Proteomics. 2010 Oct;7(5):679-90. doi: 10.1586/epr.10.30.

DOI:10.1586/epr.10.30
PMID:20973641
Abstract

Interactions between proteins are central to any cellular process, and mapping these into a protein network is informative both for the function of individual proteins and the functional organization of the cell as a whole. Many strategies have been developed that are up to this task, and the last 10 years have seen the high-throughput application of a number of those in large-scale, sometimes proteome-wide, interactome mapping efforts. Although initially the quality of the data produced in these screening campaigns has been questioned, quality standards and empirical validation schemes are now in place to ensure high-quality data generation. Through their integration with other 'omics' data, interactomics datasets have proven highly valuable towards applications in different areas of clinical importance.

摘要

蛋白质之间的相互作用是所有细胞过程的核心,将这些相互作用映射到蛋白质网络中,不仅可以了解单个蛋白质的功能,还可以了解整个细胞的功能组织。为此已经开发了许多策略,并且在过去的 10 年中,已经在大规模的、有时是整个蛋白质组范围内的相互作用组映射工作中应用了其中的许多策略。尽管最初人们对这些筛选实验产生的数据的质量提出了质疑,但现在已经制定了质量标准和经验验证方案,以确保生成高质量的数据。通过与其他“组学”数据的整合,相互作用组数据集已被证明在应用于具有临床重要性的不同领域方面非常有价值。

相似文献

1
Large-scale protein interactome mapping: strategies and opportunities.大规模蛋白质相互作用组学图谱绘制:策略与机遇。
Expert Rev Proteomics. 2010 Oct;7(5):679-90. doi: 10.1586/epr.10.30.
2
Interactome: gateway into systems biology.相互作用组:通往系统生物学的大门。
Hum Mol Genet. 2005 Oct 15;14 Spec No. 2:R171-81. doi: 10.1093/hmg/ddi335. Epub 2005 Sep 14.
3
Interactome mapping for analysis of complex phenotypes: insights from benchmarking binary interaction assays.互作组图谱绘制分析复杂表型:来自二元互作检测基准测试的见解。
Proteomics. 2012 May;12(10):1499-518. doi: 10.1002/pmic.201100598.
4
Mapping the human protein interactome.绘制人类蛋白质相互作用组图谱。
Cell Res. 2008 Jul;18(7):716-24. doi: 10.1038/cr.2008.72.
5
Functional proteomics: mapping protein-protein interactions and pathways.功能蛋白质组学:绘制蛋白质-蛋白质相互作用及信号通路图谱。
Curr Opin Mol Ther. 2002 Jun;4(3):210-5.
6
Approaches for systematic proteome exploration.系统蛋白质组探索方法。
Biomol Eng. 2007 Jun;24(2):155-68. doi: 10.1016/j.bioeng.2007.01.001. Epub 2007 Feb 6.
7
Interaction proteomics.相互作用蛋白质组学
Biosci Rep. 2005 Feb-Apr;25(1-2):45-56. doi: 10.1007/s10540-005-2847-z.
8
Whole-proteome prediction of protein function via graph-theoretic analysis of interaction maps.通过相互作用图谱的图论分析对蛋白质功能进行全蛋白质组预测。
Bioinformatics. 2005 Jun;21 Suppl 1:i302-10. doi: 10.1093/bioinformatics/bti1054.
9
The Cartographers toolbox: building bigger and better human protein interaction networks.制图师工具箱:构建更大更好的人类蛋白质相互作用网络。
Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jan;8(1):1-11. doi: 10.1093/bfgp/elp003. Epub 2009 Mar 12.
10
Charting plant interactomes: possibilities and challenges.绘制植物互作组:可能性与挑战。
Trends Plant Sci. 2008 Apr;13(4):183-91. doi: 10.1016/j.tplants.2008.01.006. Epub 2008 Mar 7.

引用本文的文献

1
PorV factor of the type IX secretion system and PosF porin act as adhesins in Riemerella anatipestifer infection.IX型分泌系统的PorV因子和孔蛋白PosF在鸭疫里默氏菌感染中作为黏附素发挥作用。
Vet Res. 2025 Jun 8;56(1):112. doi: 10.1186/s13567-025-01550-8.
2
Proteomimetic surface fragments distinguish targets by function.拟蛋白质表面片段通过功能区分靶标。
Chem Sci. 2020 Sep 10;11(38):10390-10398. doi: 10.1039/d0sc03525d.
3
The online Tabloid Proteome: an annotated database of protein associations.在线小报蛋白质组学:蛋白质关联注释数据库。
Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D581-D585. doi: 10.1093/nar/gkx930.
4
Bioinformatics and Moonlighting Proteins.生物信息学与兼职蛋白。
Front Bioeng Biotechnol. 2015 Jun 24;3:90. doi: 10.3389/fbioe.2015.00090. eCollection 2015.
5
Quantifying domain-ligand affinities and specificities by high-throughput holdup assay.通过高通量滞留测定法量化结构域-配体亲和力和特异性
Nat Methods. 2015 Aug;12(8):787-93. doi: 10.1038/nmeth.3438. Epub 2015 Jun 8.
6
2P2I HUNTER: a tool for filtering orthosteric protein-protein interaction modulators via a dedicated support vector machine.2P2I HUNTER:一种通过专用支持向量机筛选正构蛋白-蛋白相互作用调节剂的工具。
J R Soc Interface. 2013 Nov 6;11(90):20130860. doi: 10.1098/rsif.2013.0860. Print 2014 Jan 6.
7
Integrative proteomic profiling of protein activity and interactions using protein arrays.利用蛋白质芯片进行蛋白质活性和相互作用的综合蛋白质组学分析。
Mol Cell Proteomics. 2012 Nov;11(11):1167-76. doi: 10.1074/mcp.M112.016964. Epub 2012 Jul 26.
8
Exploring mixed microbial community functioning: recent advances in metaproteomics.探索混合微生物群落功能:元蛋白质组学的最新进展。
FEMS Microbiol Ecol. 2012 May;80(2):265-80. doi: 10.1111/j.1574-6941.2011.01284.x. Epub 2012 Jan 16.
9
How do dynamic cellular signals travel long distances?动态细胞信号是如何远距离传播的?
Mol Biosyst. 2012 Jan;8(1):22-6. doi: 10.1039/c1mb05205e. Epub 2011 Jul 18.