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瓦德(Vader)在黑曲霉中转座子介导的诱变中的适用性。

Suitability of Vader for transposon-mediated mutagenesis in Aspergillus niger.

机构信息

Abteilung Botanische Genetik und Molekularbiologie, Botanisches Institut und Botanischer Garten, Olshausenstr. 40, 24098 Kiel, Germany.

出版信息

Appl Environ Microbiol. 2011 Apr;77(7):2332-6. doi: 10.1128/AEM.02688-10. Epub 2011 Feb 4.

Abstract

The filamentous fungus Aspergillus niger is widely used in biotechnological applications. Strain CBS513.88 is known to harbor 21 copies of the nonautonomous transposon Vader. Upon selection of chlorate-resistant A. niger colonies, one Vader copy was found integrated in the nirA gene. This copy was used for vector construction and development of a transposon-tagging method. Vader showed an excision frequency of about 1 in 2.2 × 10(5) conidiospores. A total of 95 of 97 colonies analyzed exhibited an excision event at the DNA level, and Vader footprints were found. By employing thermal asymmetric interlaced (TAIL)-PCR, the reintegration sites of 21 independent excision events were determined. All reintegration events occurred within or very close to genes. Therefore, this method can be used for transposon mutagenesis in A. niger.

摘要

黑曲霉是一种丝状真菌,被广泛应用于生物技术领域。CBS513.88 菌株携带有 21 个非自主转座子 Vader。在筛选出对氯酸盐具有抗性的黑曲霉菌落时,发现 Vader 的一个拷贝整合到了 nirA 基因中。该拷贝被用于载体构建,并开发了一种转座子标签法。Vader 的切除频率约为每 2.2×10(5)个分生孢子中有 1 次。在分析的 97 个菌落中,有 95 个在 DNA 水平上发生了切除事件,并找到了 Vader 足迹。通过采用热不对称交错(TAIL)-PCR,确定了 21 个独立切除事件的重新整合位点。所有的重新整合事件都发生在基因内或非常接近基因的位置。因此,这种方法可用于黑曲霉的转座子诱变。

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Appl Microbiol Biotechnol. 2016 Jul;100(14):6309-6317. doi: 10.1007/s00253-016-7438-3. Epub 2016 Mar 22.

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