Suppr超能文献

通讯:准确测定蛋白质中环侧链扭转角 χ1:苯丙氨酸残基。

Communication: Accurate determination of side-chain torsion angle χ1 in proteins: phenylalanine residues.

机构信息

Departamento de Química Física, Facultad de Química, Universidad de la Habana, La Habana 10400, Cuba.

出版信息

J Chem Phys. 2011 Feb 14;134(6):061101. doi: 10.1063/1.3553204.

Abstract

Quantitative side-chain torsion angle χ(1) determinations of phenylalanine residues in Desulfovibrio vulgaris flavodoxin are carried out using exclusively the correlation between the experimental vicinal coupling constants and theoretically determined Karplus equations. Karplus coefficients for nine vicinal coupling related with the torsion angle χ(1) were calculated using the B3LYP functional and basis sets of different size. Optimized χ(1) angles are in outstanding agreement with those previously reported by employing x ray and NMR measurements.

摘要

采用实验偶极耦合常数与理论确定的 Karplus 方程之间的相关性,对脱硫弧菌黄素蛋白中苯丙氨酸残基的定量侧链扭转角 χ(1) 进行了测定。使用 B3LYP 函数和不同大小的基组计算了与扭转角 χ(1) 相关的 9 个偶极耦合相关的 Karplus 系数。优化后的 χ(1) 角度与先前通过 X 射线和 NMR 测量报告的角度非常吻合。

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