• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

线虫水平基因转移的计算和系统发育验证。

Computational and phylogenetic validation of nematode horizontal gene transfer.

机构信息

Department of Plant Pathology, NC State University, Raleigh, NC 27695, USA.

出版信息

BMC Biol. 2011 Feb 22;9:9. doi: 10.1186/1741-7007-9-9.

DOI:10.1186/1741-7007-9-9
PMID:21342537
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3042989/
Abstract

Sequencing of expressed genes has shown that nematodes, particularly the plant-parasitic nematodes, have genes purportedly acquired from other kingdoms by horizontal gene transfer. The prevailing orthodoxy is that such transfer has been a driving force in the evolution of niche specificity, and a recent paper in BMC Evolutionary Biology that presents a detailed phylogenetic analysis of cellulase genes in the free-living nematode Pristionchus pacificus at the species, genus and family levels substantiates this hypothesis.

摘要

表达基因的测序表明,线虫,特别是植物寄生线虫,拥有据称是通过水平基因转移从其他生物界获得的基因。流行的正统观点是,这种转移是生态位特化进化的驱动力,最近发表在 BMC 进化生物学杂志上的一篇论文详细分析了自由生活的线虫 Pristionchus pacificus 的纤维素酶基因在种、属和科三个水平上的系统进化,支持了这一假说。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a47e/3042989/7f330b7e48e6/1741-7007-9-9-1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a47e/3042989/7f330b7e48e6/1741-7007-9-9-1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a47e/3042989/7f330b7e48e6/1741-7007-9-9-1.jpg

相似文献

1
Computational and phylogenetic validation of nematode horizontal gene transfer.线虫水平基因转移的计算和系统发育验证。
BMC Biol. 2011 Feb 22;9:9. doi: 10.1186/1741-7007-9-9.
2
Horizontal gene transfer of microbial cellulases into nematode genomes is associated with functional assimilation and gene turnover.微生物纤维素酶的水平基因转移到线虫基因组中与功能同化和基因更替有关。
BMC Evol Biol. 2011 Jan 13;11:13. doi: 10.1186/1471-2148-11-13.
3
Computational archaeology of the Pristionchus pacificus genome reveals evidence of horizontal gene transfers from insects.太平洋多毛虫基因组的计算考古学揭示了来自昆虫的水平基因转移的证据。
BMC Evol Biol. 2011 Aug 15;11:239. doi: 10.1186/1471-2148-11-239.
4
Phylogeny of the nematode genus Pristionchus and implications for biodiversity, biogeography and the evolution of hermaphroditism.线虫属普氏线虫的系统发育及其对生物多样性、生物地理学和雌雄同体进化的意义。
BMC Evol Biol. 2007 Jul 2;7:104. doi: 10.1186/1471-2148-7-104.
5
Role of horizontal gene transfer in the evolution of plant parasitism among nematodes.水平基因转移在植物寄生线虫进化中的作用
Methods Mol Biol. 2009;532:517-35. doi: 10.1007/978-1-60327-853-9_30.
6
Evolution of GHF5 endoglucanase gene structure in plant-parasitic nematodes: no evidence for an early domain shuffling event.植物寄生线虫中GHF5内切葡聚糖酶基因结构的演变:无早期结构域改组事件的证据
BMC Evol Biol. 2008 Nov 3;8:305. doi: 10.1186/1471-2148-8-305.
7
Characterization of a new beta-1,4-endoglucanase gene from the root-knot nematode Meloidogyne incognita and evolutionary scheme for phytonematode family 5 glycosyl hydrolases.南方根结线虫新β-1,4-内切葡聚糖酶基因的鉴定及植物寄生线虫家族5糖基水解酶的进化图谱
Gene. 2006 Nov 1;382:121-8. doi: 10.1016/j.gene.2006.06.023. Epub 2006 Jul 18.
8
Expressional and functional variation of horizontally acquired cellulases in the nematode Pristionchus pacificus.太平洋真涡虫中水平获得的纤维素酶的表达和功能变化。
Gene. 2012 Sep 15;506(2):274-82. doi: 10.1016/j.gene.2012.07.013. Epub 2012 Jul 17.
9
Genomic organization of four beta-1,4-endoglucanase genes in plant-parasitic cyst nematodes and its evolutionary implications.植物寄生性胞囊线虫中四个β-1,4-内切葡聚糖酶基因的基因组组织及其进化意义。
Gene. 1998 Oct 5;220(1-2):61-70. doi: 10.1016/s0378-1119(98)00413-2.
10
Distribution and evolution of glycoside hydrolase family 45 cellulases in nematodes and fungi.糖苷水解酶家族 45 纤维素酶在线虫和真菌中的分布与进化。
BMC Evol Biol. 2014 Apr 1;14:69. doi: 10.1186/1471-2148-14-69.

引用本文的文献

1
Understanding pine wilt disease: roles of the pine endophytic bacteria and of the bacteria carried by the disease-causing pinewood nematode.了解松材线虫病:松树内生细菌及致病松材线虫携带细菌的作用
Microbiologyopen. 2017 Apr;6(2). doi: 10.1002/mbo3.415. Epub 2016 Oct 26.
2
Diversity of bacteria carried by pinewood nematode in USA and phylogenetic comparison with isolates from other countries.美国松材线虫携带细菌的多样性及其与其他国家分离株的系统发育比较。
PLoS One. 2014 Aug 15;9(8):e105190. doi: 10.1371/journal.pone.0105190. eCollection 2014.
3
Horizontal gene transfer in plants.

本文引用的文献

1
Horizontal gene transfer of microbial cellulases into nematode genomes is associated with functional assimilation and gene turnover.微生物纤维素酶的水平基因转移到线虫基因组中与功能同化和基因更替有关。
BMC Evol Biol. 2011 Jan 13;11:13. doi: 10.1186/1471-2148-11-13.
2
Multiple lateral gene transfers and duplications have promoted plant parasitism ability in nematodes.多次侧向基因转移和重复促进了线虫的植物寄生能力。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Oct 12;107(41):17651-6. doi: 10.1073/pnas.1008486107. Epub 2010 Sep 27.
3
The genomes of root-knot nematodes.
植物中的水平基因转移
Funct Integr Genomics. 2014 Mar;14(1):23-9. doi: 10.1007/s10142-013-0345-0. Epub 2013 Oct 17.
4
Metagenomic analysis of the pinewood nematode microbiome reveals a symbiotic relationship critical for xenobiotics degradation.宏基因组分析表明松材线虫微生物组存在共生关系,该关系对于降解外来化合物至关重要。
Sci Rep. 2013;3:1869. doi: 10.1038/srep01869.
5
Nematode-bacterium symbioses--cooperation and conflict revealed in the "omics" age.线虫-细菌共生关系——“组学”时代揭示的合作与冲突
Biol Bull. 2012 Aug;223(1):85-102. doi: 10.1086/BBLv223n1p85.
根结线虫的基因组。
Annu Rev Phytopathol. 2009;47:333-51. doi: 10.1146/annurev-phyto-080508-081839.
4
Sequence and genetic map of Meloidogyne hapla: A compact nematode genome for plant parasitism.北方根结线虫的序列与遗传图谱:一个用于植物寄生的紧凑线虫基因组。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Sep 30;105(39):14802-7. doi: 10.1073/pnas.0805946105. Epub 2008 Sep 22.
5
The Pristionchus pacificus genome provides a unique perspective on nematode lifestyle and parasitism.太平洋小杆线虫基因组为线虫的生活方式和寄生现象提供了独特的视角。
Nat Genet. 2008 Oct;40(10):1193-8. doi: 10.1038/ng.227. Epub 2008 Sep 21.
6
Horizontally transferred genes in plant-parasitic nematodes: a high-throughput genomic approach.植物寄生线虫中的水平转移基因:一种高通量基因组学方法。
Genome Biol. 2003;4(6):R39. doi: 10.1186/gb-2003-4-6-r39. Epub 2003 May 19.
7
Endogenous cellulases in animals: isolation of beta-1, 4-endoglucanase genes from two species of plant-parasitic cyst nematodes.动物体内的内源性纤维素酶:从两种植物寄生性胞囊线虫中分离β-1, 4-内切葡聚糖酶基因
Proc Natl Acad Sci U S A. 1998 Apr 28;95(9):4906-11. doi: 10.1073/pnas.95.9.4906.