Department of Genetics, North Carolina State University, North Carolina Department of Animal Sciences, Purdue University, Indiana, USA.
J Anim Breed Genet. 1994 Jan 12;111(1-6):178-88. doi: 10.1111/j.1439-0388.1994.tb00456.x.
Patterson and Thompson's idea of 'error contrasts' (or restricted maximum likelihood) (1971) was extended to multiple sets of linear contrasts for variance component estimtion. The error contrasts were established in such a way that only errors are retained in the model. The error variance was then estimated by maximizing the likelihood function obtained from the error contrasts. More sets of linear contrasts were then progressively established such that each set of linear contrasts contains only one class of random effects and the errors. A likelihood function was constructed and maximized for each variance of random effects given the error variance held at its estimated value. The likelihood function for estimating the covariance component between two classes of random effects was established such that all other random effects are treated as fixed effects. The likelihood function was then maximized with respect to the covariance given the two variance components fixed at their estimated values. The multidimensional optimization problem in the traditional restricted maximum-likelihood problem was then turned into several one-dimensional optimization problems by using this technique. Inasmuch as the error variance was estimated using a partial likelihood function and the other variance components are estimated using likelihood functions conditional on the estimated error variance, the method is referred to as partial and conditional maximum likelihood (PCML). ZUSAMMENFASSUNG: Partielle und bedingte Maximum Likelihood zur Schätzung von Varianzkomponenten Die Patterson und Thompson Vorstellungen von 'Fehlerkontrasten' (1971) (oder beschränkte maximale Likelihood) wurde auf multiple Gruppen linearer Kontraste für Varianzkomponenten- schätzung ausgedehnt. Die Fehlerkontraste erfolgen in der Form, daß nur Fehler im Modell verbleiben. Die Fehlervarianz wurde dann durch Maximierung der Likelihood Funktion von Fehlerkontrasten geschätzt. Weitere Gruppen linearer Kontraste wurden nacheinander etabliert dergestalt, daß jede Gruppe linearer Kontraste nur eine Klasse zufälliger Wirkungen und die Fehler enthält. Eine Likelihood Funktion wurde konstruiert und für jede Varianz von Zufallsgrößen maximiert unter der Voraussetzung, daß die Fehlervarianz auf ihrem geschätzten Wert verbleibt. Die Likelihood Funktion zur Schätzung der Ko-Varianzkomponenten zwischen zwei Klassen zufälliger Wirkungen wurde in der Form aufgestellt, daß alle anderen Zufallswirkungen als fixe behandelt werden. Die Likelihood Funktion wurde maximiert im Hinblick auf Ko-Varianz bei gegebenen geschätzten Varianzkomponenten. Das multidimensionale Optimierungsproblem der traditionellen restringierten Maximum Likelihood wurde auf diese Weise in ein eindimensionales Optimierungsproblem verwandelt. Nachdem die Fehlervarianz aus der partiellen Likelihood Funktion und die anderen Varianzkomponenten unter Verwendung der bedingten Likelihood Funktionen geschätzt worden waren, wurde die Methode als partielle und bedingte Maximum Likelihood (pcml) bezeichnet.
帕特森和汤普森的“误差对比”(或限制最大似然)(1971 年)的思想被扩展到多个线性对比组,以进行方差分量估计。误差对比以仅保留模型中的误差的方式建立。然后通过最大化来自误差对比的似然函数来估计误差方差。然后逐步建立更多的线性对比组,使得每组线性对比仅包含一类随机效应和误差。为每个随机效应的方差构建并最大化似然函数,同时将误差方差保持在其估计值。建立了两个随机效应类之间的协方差分量的似然函数,使得所有其他随机效应都被视为固定效应。然后,在给定两个方差分量固定在其估计值的情况下,最大化协方差的似然函数。通过使用这种技术,将传统的限制最大似然问题中的多维优化问题转化为几个一维优化问题。由于使用部分似然函数估计误差方差,并且使用条件似然函数估计其他方差分量,因此该方法称为部分和条件最大似然(PCML)。