Suppr超能文献

全同胞组均值估计方差和协方差分量的效率:连续或二项记录。

Efficiency of estimation of variance and covariance components from full-sib group means for continuous or binary records.

机构信息

AKVAFORSK (Institute of Aquaculture Research Ltd.), Aas Department of Animal Husbandry and Animal Breeding, Animal Genetics Group, University of Hohenheim, Stuttgart, Germany.

出版信息

J Anim Breed Genet. 1997 Jan 12;114(1-6):349-62. doi: 10.1111/j.1439-0388.1997.tb00520.x.

Abstract

High fecundity in fish allows for testing of large full-sib groups and testing of sub-samples of each group for different traits in different environments, and this benefit is especially useful when traits cannot be measured on the breeding candidate itself. A MIVQUE-method that compresses the information in such data, by estimating variance components based on full-sib mean data, is presented for a two-trait model. The efficiency of this method is compared in a simulation study with a model using an individual observation vector when estimating additive genetic and residual (co)variances. The effect on efficiency of continuous versus binary traits, of varied average number of full-sibs, of varied frequencies in the binary traits, of different combinations of frequencies in the two binary traits, of different heritabilities, of different genetic correlations, and of two different design sizes were studied. Generally, all parameters influenced the efficiency, and this influence was larger on the residual, than on the additive genetic variance component. The proposed methodology will be especially well-suited for analysing binary traits because the residual variance component can be calculated via the phenotypic variance, which can be estimated on basis of the frequency of the trait. ZUSAMMENFASSUNG: Effizienz der Schaetzung von Varianz- und Kovarianzkomponenten aus Vollgeschwistergruppen-Mitelwerten bei kontinuierlichen und dichotomen Merkmalen Die hohe Vermehrungsrate von Fischen erlaubt es, große Vollgeschwistergruppen zu pruefen und auch Stichproben aus diesen für verschiedene Merkmale in verschiedenen Umwelten zu testen. Dies ist besonders hilfreich, wenn die interessierenden Merkmale nicht an den zu selektierenden Individuen erhoben werden können. Es wird ein MIVQUE-Ansatz zur Varianz- und Kovarianzkomponentenschätzung fuer ein Zwei-Merkmalsmodell vorgestellt, der auf der Beruecksichtigung von Vollgeschwistergruppen-Mittelwerten beruht. Die Effizienz dieses Ansatzes wird in einer Simulationsstudie untersucht, indem dieser mit einem auf individuellen Leistungen basierenden Ansatz verglichen wird. Dabei wird untersucht, welche Unterschiede sich bei kontinuierlichen und dichotomen Variablen ergeben sowie der Einfluß verschiedener Gruppengroessen, verschiedener Frequenzen der dichotomen Variablen, unterschiedlicher Heritabilitaeten und genetischer Korrelationen sowie zweier unterschiedlicher Designs. Im Allgemeinen waren die Einfluesse auf die geschaetzte Restvarianz immer groesser als die auf die genetischen Varianzkomponenten. Die vorgeschlagene Methode erwies sich als besonders geeignet fuer die Auswertung dichotomer Merkmale, weil dort die Groesse der Restvarianz sehr einfach aus der phaenotypischen Varianz approximiert werden kann, welche wiederum aus der beobachteten Frequenz des Merkmals gut zu schaetzen ist.

摘要

高繁殖力使鱼类能够对大量全同胞群体进行测试,并对每个群体的亚样本进行不同性状在不同环境下的测试,这对于无法在候选繁殖个体上测量性状的情况特别有用。本文提出了一种 MIVQUE 方法,通过基于全同胞均值数据估计方差分量,对两性状模型进行信息压缩。通过在使用个体观测向量的模型中估计加性遗传和残差(协)方差,对该方法的效率进行了模拟研究。当估计加性遗传方差和残差方差时,连续性状和二项性状、不同平均全同胞数量、不同二项性状频率、不同二项性状频率组合、不同遗传力、不同遗传相关性以及两种不同设计规模的影响进行了研究。一般来说,所有参数都对效率有影响,而且这种影响在残差方差分量上比加性遗传方差分量上更大。该方法特别适用于分析二项性状,因为可以通过表型方差来计算残差方差分量,而表型方差可以根据性状的频率来估计。

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