• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

在酿酒酵母中,一种包含 Sec13 和 Seh1 的保守的COP 相关复合物与液泡动态相关。

A conserved coatomer-related complex containing Sec13 and Seh1 dynamically associates with the vacuole in Saccharomyces cerevisiae.

机构信息

Institut Jacques Monod, CNRS UMR 7592, Bâtiment Buffon, Paris, France.

出版信息

Mol Cell Proteomics. 2011 Jun;10(6):M110.006478. doi: 10.1074/mcp.M110.006478. Epub 2011 Mar 31.

DOI:10.1074/mcp.M110.006478
PMID:21454883
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3108837/
Abstract

The presence of multiple membrane-bound intracellular compartments is a major feature of eukaryotic cells. Many of the proteins required for formation and maintenance of these compartments share an evolutionary history. Here, we identify the SEA (Seh1-associated) protein complex in yeast that contains the nucleoporin Seh1 and Sec13, the latter subunit of both the nuclear pore complex and the COPII coating complex. The SEA complex also contains Npr2 and Npr3 proteins (upstream regulators of TORC1 kinase) and four previously uncharacterized proteins (Sea1-Sea4). Combined computational and biochemical approaches indicate that the SEA complex proteins possess structural characteristics similar to the membrane coating complexes COPI, COPII, the nuclear pore complex, and, in particular, the related Vps class C vesicle tethering complexes HOPS and CORVET. The SEA complex dynamically associates with the vacuole in vivo. Genetic assays indicate a role for the SEA complex in intracellular trafficking, amino acid biogenesis, and response to nitrogen starvation. These data demonstrate that the SEA complex is an additional member of a family of membrane coating and vesicle tethering assemblies, extending the repertoire of protocoatomer-related complexes.

摘要

多种膜结合的细胞内隔室的存在是真核细胞的主要特征。许多形成和维持这些隔室所需的蛋白质具有共同的进化历史。在这里,我们在酵母中鉴定了 SEA(Seh1 相关)蛋白复合物,该复合物包含核孔蛋白 Seh1 和 Sec13,后者是核孔复合物和 COPII 涂层复合物的亚基。SEA 复合物还包含 Npr2 和 Npr3 蛋白(TORC1 激酶的上游调节剂)和四个以前未被表征的蛋白(Sea1-Sea4)。组合的计算和生化方法表明,SEA 复合物蛋白具有与膜涂层复合物 COPI、COPII、核孔复合物相似的结构特征,特别是与相关的 Vps 类 C 囊泡连接复合物 HOPS 和 CORVET。SEA 复合物在体内与液泡动态相关。遗传分析表明,SEA 复合物在细胞内运输、氨基酸生物发生和对氮饥饿的反应中起作用。这些数据表明,SEA 复合物是膜涂层和囊泡连接组装的另一个成员,扩展了原核蛋白相关复合物的范围。

相似文献

1
A conserved coatomer-related complex containing Sec13 and Seh1 dynamically associates with the vacuole in Saccharomyces cerevisiae.在酿酒酵母中,一种包含 Sec13 和 Seh1 的保守的COP 相关复合物与液泡动态相关。
Mol Cell Proteomics. 2011 Jun;10(6):M110.006478. doi: 10.1074/mcp.M110.006478. Epub 2011 Mar 31.
2
A novel coatomer-related SEA complex dynamically associates with the vacuole in yeast and is implicated in the response to nitrogen starvation.一种新型与衣被小泡复合体相关的 SEA 复合物在酵母中与液泡动态相关,并与对氮饥饿的反应有关。
Autophagy. 2011 Nov;7(11):1392-3. doi: 10.4161/auto.7.11.17347. Epub 2011 Nov 1.
3
SEACing the GAP that nEGOCiates TORC1 activation: evolutionary conservation of Rag GTPase regulation.SEACing 调节 TORC1 激活的 GAP: Rag GTPase 调节的进化保守性。
Cell Cycle. 2013 Sep 15;12(18):2948-52. doi: 10.4161/cc.26000. Epub 2013 Aug 13.
4
The CORVET tethering complex interacts with the yeast Rab5 homolog Vps21 and is involved in endo-lysosomal biogenesis.CORVET拴系复合体与酵母Rab5同源物Vps21相互作用,并参与内溶酶体生物发生。
Dev Cell. 2007 May;12(5):739-50. doi: 10.1016/j.devcel.2007.03.006.
5
The HOPS/Class C Vps Complex Tethers High-Curvature Membranes via a Direct Protein-Membrane Interaction.HOPS/C类Vps复合物通过直接的蛋白质-膜相互作用连接高曲率膜。
Traffic. 2016 Oct;17(10):1078-90. doi: 10.1111/tra.12421. Epub 2016 Jul 15.
6
A fence-like coat for the nuclear pore membrane.一种用于核孔膜的栅栏状覆盖物。
Mol Cell. 2008 Dec 26;32(6):815-26. doi: 10.1016/j.molcel.2008.12.001.
7
Subunit organization and Rab interactions of Vps-C protein complexes that control endolysosomal membrane traffic.控制内体溶酶体膜运输的 Vps-C 蛋白复合物的亚基组成和 Rab 相互作用。
Mol Biol Cell. 2011 Apr 15;22(8):1353-63. doi: 10.1091/mbc.E10-03-0260. Epub 2011 Feb 16.
8
Involvement of the penta-EF-hand protein Pef1p in the Ca2+-dependent regulation of COPII subunit assembly in Saccharomyces cerevisiae.五 EF 手蛋白 Pef1p 参与酵母中 COPII 亚基组装的 Ca2+依赖性调节。
PLoS One. 2012;7(7):e40765. doi: 10.1371/journal.pone.0040765. Epub 2012 Jul 11.
9
Subunit exchange among endolysosomal tethering complexes is linked to contact site formation at the vacuole.内溶酶体连接复合物之间的亚基交换与液泡处接触位点的形成有关。
Mol Biol Cell. 2021 Dec 1;32(22):br14. doi: 10.1091/mbc.E21-05-0227. Epub 2021 Oct 20.
10
Structure of the Sec13-Sec16 edge element, a template for assembly of the COPII vesicle coat.Sec13-Sec16 边缘元件的结构,是 COPII 囊泡被膜组装的模板。
J Cell Biol. 2010 Aug 9;190(3):347-61. doi: 10.1083/jcb.201003092.

引用本文的文献

1
A closer look at how cells sense dietary nutrients.深入探究细胞如何感知膳食营养。
Nature. 2025 Aug 27. doi: 10.1038/d41586-025-02694-5.
2
Eukaryote-Wide Distribution of a Family of Longin Domain-Containing GAP Complexes for Small GTPases.小GTP酶的含长in结构域的GAP复合物家族在真核生物中的广泛分布。
Traffic. 2025 Jul;26(7-9):e70016. doi: 10.1111/tra.70016.
3
The 50-nm Free Vesicles Visible in Are Not COPII-Dependent.在[具体情况未提及处]可见的50纳米游离囊泡不依赖于COPII。
Curr Issues Mol Biol. 2025 May 7;47(5):336. doi: 10.3390/cimb47050336.
4
Unveiling GATOR2 Function: Novel Insights from Drosophila Research.揭示 GATOR2 功能:来自果蝇研究的新见解。
Cells. 2024 Oct 30;13(21):1795. doi: 10.3390/cells13211795.
5
Ragopathies and the rising influence of RagGTPases on human diseases.Rag 蛋白病与 RagGTPases 对人类疾病日益增长的影响。
Nat Commun. 2024 Jul 10;15(1):5812. doi: 10.1038/s41467-024-50034-4.
6
Structures and Functions of the Human GATOR1 Complex.人类 GATOR1 复合物的结构与功能。
Subcell Biochem. 2024;104:269-294. doi: 10.1007/978-3-031-58843-3_12.
7
Yeast TLDc domain proteins regulate assembly state and subcellular localization of the V-ATPase.酵母 TLDc 结构域蛋白调控 V-ATPase 的组装状态和亚细胞定位。
EMBO J. 2024 May;43(9):1870-1897. doi: 10.1038/s44318-024-00097-2. Epub 2024 Apr 8.
8
The GATOR2 complex maintains lysosomal-autophagic function by inhibiting the protein degradation of MiT/TFEs.GATOR2 复合物通过抑制 MiT/TFE 的蛋白降解来维持溶酶体自噬功能。
Mol Cell. 2024 Feb 15;84(4):727-743.e8. doi: 10.1016/j.molcel.2024.01.012. Epub 2024 Feb 6.
9
Functional differentiation of Sec13 paralogues in the euglenozoan protists.Sec13 同源物在眼虫动物门原生动物中的功能分化。
Open Biol. 2023 Jun;13(6):220364. doi: 10.1098/rsob.220364. Epub 2023 Jun 14.
10
Wdr59 promotes or inhibits TORC1 activity depending on cellular context.Wdr59 根据细胞环境促进或抑制 TORC1 活性。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2023 Jan 3;120(1):e2212330120. doi: 10.1073/pnas.2212330120. Epub 2022 Dec 28.

本文引用的文献

1
The conserved Bardet-Biedl syndrome proteins assemble a coat that traffics membrane proteins to cilia.Bardet-Biedl 综合征相关蛋白形成一个外壳,将膜蛋白运输到纤毛。
Cell. 2010 Jun 25;141(7):1208-19. doi: 10.1016/j.cell.2010.05.015.
2
Structure of coatomer cage proteins and the relationship among COPI, COPII, and clathrin vesicle coats.衣被小体蛋白的结构以及 COPI、COPII 和网格蛋白囊泡被膜之间的关系。
Cell. 2010 Jul 9;142(1):123-32. doi: 10.1016/j.cell.2010.05.030. Epub 2010 Jun 24.
3
A global protein kinase and phosphatase interaction network in yeast.酵母中全局的蛋白激酶和磷酸酶相互作用网络。
Science. 2010 May 21;328(5981):1043-6. doi: 10.1126/science.1176495.
4
Npr2, yeast homolog of the human tumor suppressor NPRL2, is a target of Grr1 required for adaptation to growth on diverse nitrogen sources.Npr2是人类肿瘤抑制因子NPRL2的酵母同源物,是适应多种氮源生长所需的Grr1的靶标。
Eukaryot Cell. 2010 Apr;9(4):592-601. doi: 10.1128/EC.00192-09. Epub 2010 Feb 12.
5
The genetic landscape of a cell.细胞的基因图谱。
Science. 2010 Jan 22;327(5964):425-31. doi: 10.1126/science.1180823.
6
The compartmentalized bacteria of the planctomycetes-verrucomicrobia-chlamydiae superphylum have membrane coat-like proteins.厚壁菌门-浮霉菌门-螺旋体菌超门的分隔细菌具有膜壳状蛋白。
PLoS Biol. 2010 Jan 19;8(1):e1000281. doi: 10.1371/journal.pbio.1000281.
7
Patch-based nonlocal functional for denoising fluorescence microscopy image sequences.基于补丁的非局部函数在荧光显微镜图像序列去噪中的应用。
IEEE Trans Med Imaging. 2010 Feb;29(2):442-54. doi: 10.1109/TMI.2009.2033991. Epub 2009 Nov 6.
8
The Nup107-160 nucleoporin complex promotes mitotic events via control of the localization state of the chromosome passenger complex.核孔复合体 Nup107-160 通过调控染色体乘客复合物的定位状态促进有丝分裂事件。
Mol Biol Cell. 2009 Dec;20(24):5260-75. doi: 10.1091/mbc.e09-05-0377.
9
Resolving the composition of protein complexes using a MALDI LTQ Orbitrap.利用 MALDI LTQ Orbitrap 解析蛋白质复合物的组成。
J Am Soc Mass Spectrom. 2010 Jan;21(1):34-46. doi: 10.1016/j.jasms.2009.08.026. Epub 2009 Sep 17.
10
Partial internal reflections on total internal reflection fluorescent microscopy.全内反射荧光显微镜中的部分内反射
Trends Cell Biol. 2009 Nov;19(11):661-8. doi: 10.1016/j.tcb.2009.08.003. Epub 2009 Oct 7.