• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

APOBEC3G/3F 的表达与 HIV-1 感染儿童疾病进展不同特征相关的 G-to-A 高突变率。

Expression of APOBEC3G/3F and G-to-A hypermutation levels in HIV-1-infected children with different profiles of disease progression.

机构信息

Instituto de Bioquímica Médica, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.

出版信息

PLoS One. 2011;6(8):e24118. doi: 10.1371/journal.pone.0024118. Epub 2011 Aug 29.

DOI:10.1371/journal.pone.0024118
PMID:21897871
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3163681/
Abstract

OBJECTIVE

Increasing evidence has accumulated showing the role of APOBEC3G (A3G) and 3F (A3F) in the control of HIV-1 replication and disease progression in humans. However, very few studies have been conducted in HIV-infected children. Here, we analyzed the levels of A3G and A3F expression and induced G-to-A hypermutation in a group of children with distinct profiles of disease progression.

METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Perinatally HIV-infected children were classified as progressors or long-term non-progressors according to criteria based on HIV viral load and CD4 T-cell counts over time. A group of uninfected control children were also enrolled in the study. PBMC proviral DNA was assessed for G-to-A hypermutation, whereas A3G and A3F mRNA were isolated and quantified through TaqMan® real-time PCR. No correlation was observed between disease progression and A3G/A3F expression or hypermutation levels. Although all children analyzed showed higher expression levels of A3G compared to A3F (an average fold of 5 times), a surprisingly high A3F-related hypermutation rate was evidenced in the cohort, irrespective of the child's disease progression profile.

CONCLUSION

Our results contribute to the current controversy as to whether HIV disease progression is related to A3G/A3F enzymatic activity. To our knowledge, this is the first study analyzing A3G/F expression in HIV-infected children, and it may pave the way to a better understanding of the host factors governing HIV disease in the pediatric setting.

摘要

目的

越来越多的证据表明 APOBEC3G(A3G)和 3F(A3F)在控制 HIV-1 复制和人类疾病进展方面发挥作用。然而,在 HIV 感染儿童中进行的研究很少。在这里,我们分析了一组具有不同疾病进展特征的儿童中 A3G 和 A3F 表达水平以及诱导的 G-to-A 超突变。

方法/主要发现:根据基于 HIV 病毒载量和 CD4 T 细胞计数随时间变化的标准,将围产期感染 HIV 的儿童分类为进展者或长期非进展者。还招募了一组未感染的对照儿童。评估 PBMC 前病毒 DNA 的 G-to-A 超突变,同时通过 TaqMan®实时 PCR 分离和定量 A3G 和 A3F mRNA。疾病进展与 A3G/A3F 表达或超突变水平之间没有相关性。尽管所有分析的儿童与 A3F 相比,A3G 的表达水平更高(平均倍数为 5 倍),但在该队列中,无论儿童的疾病进展情况如何,都发现了惊人的高 A3F 相关超突变率。

结论

我们的研究结果对 HIV 疾病进展是否与 A3G/A3F 酶活性有关的当前争议做出了贡献。据我们所知,这是第一项分析 HIV 感染儿童中 A3G/F 表达的研究,它可能为更好地理解宿主因素在儿科环境中控制 HIV 疾病铺平道路。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5e2e/3163681/4b7a4e197cdc/pone.0024118.g004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5e2e/3163681/15a0f7e843f3/pone.0024118.g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5e2e/3163681/c95ee3213cef/pone.0024118.g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5e2e/3163681/99f3618ab591/pone.0024118.g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5e2e/3163681/4b7a4e197cdc/pone.0024118.g004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5e2e/3163681/15a0f7e843f3/pone.0024118.g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5e2e/3163681/c95ee3213cef/pone.0024118.g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5e2e/3163681/99f3618ab591/pone.0024118.g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5e2e/3163681/4b7a4e197cdc/pone.0024118.g004.jpg

相似文献

1
Expression of APOBEC3G/3F and G-to-A hypermutation levels in HIV-1-infected children with different profiles of disease progression.APOBEC3G/3F 的表达与 HIV-1 感染儿童疾病进展不同特征相关的 G-to-A 高突变率。
PLoS One. 2011;6(8):e24118. doi: 10.1371/journal.pone.0024118. Epub 2011 Aug 29.
2
APOBEC3G and APOBEC3F Act in Concert To Extinguish HIV-1 Replication.载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G(APOBEC3G)和载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3F(APOBEC3F)协同作用以抑制HIV-1复制。
J Virol. 2016 Apr 14;90(9):4681-4695. doi: 10.1128/JVI.03275-15. Print 2016 May.
3
Mechanism of Enhanced HIV Restriction by Virion Coencapsidated Cytidine Deaminases APOBEC3F and APOBEC3G.病毒体共包装胞苷脱氨酶APOBEC3F和APOBEC3G增强HIV限制的机制
J Virol. 2017 Jan 18;91(3). doi: 10.1128/JVI.02230-16. Print 2017 Feb 1.
4
APOBEC3G expression and hypermutation are inversely associated with human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) burden in vivo.APOBEC3G 的表达与体内人类免疫缺陷病毒 1 型 (HIV-1) 载量呈负相关。
Virology. 2012 Aug 15;430(1):1-9. doi: 10.1016/j.virol.2012.03.018. Epub 2012 May 12.
5
Stably expressed APOBEC3F has negligible antiviral activity.稳定表达的 APOBEC3F 几乎没有抗病毒活性。
J Virol. 2010 Nov;84(21):11067-75. doi: 10.1128/JVI.01249-10. Epub 2010 Aug 11.
6
APOBEC3F and APOBEC3G inhibit HIV-1 DNA integration by different mechanisms.APOBEC3F 和 APOBEC3G 通过不同的机制抑制 HIV-1 DNA 整合。
J Virol. 2010 May;84(10):5250-9. doi: 10.1128/JVI.02358-09. Epub 2010 Mar 10.
7
Defining APOBEC3 expression patterns in human tissues and hematopoietic cell subsets.定义人类组织和造血细胞亚群中的载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样3(APOBEC3)表达模式。
J Virol. 2009 Sep;83(18):9474-85. doi: 10.1128/JVI.01089-09. Epub 2009 Jul 8.
8
APOBEC3G/3F mediates intrinsic resistance of monocyte-derived dendritic cells to HIV-1 infection.载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G/3F介导单核细胞来源的树突状细胞对HIV-1感染的内在抗性。
J Exp Med. 2006 Dec 25;203(13):2887-93. doi: 10.1084/jem.20061519. Epub 2006 Dec 4.
9
Positioning of APOBEC3G/F mutational hotspots in the human immunodeficiency virus genome favors reduced recognition by CD8+ T cells.载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G/F(APOBEC3G/F)突变热点在人类免疫缺陷病毒基因组中的定位有利于降低被CD8 + T细胞识别的可能性。
PLoS One. 2014 Apr 10;9(4):e93428. doi: 10.1371/journal.pone.0093428. eCollection 2014.
10
Differential requirement for conserved tryptophans in human immunodeficiency virus type 1 Vif for the selective suppression of APOBEC3G and APOBEC3F.人类免疫缺陷病毒1型Vif中保守色氨酸对选择性抑制载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样3G(APOBEC3G)和载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样3F(APOBEC3F)的差异需求。
J Virol. 2006 Mar;80(6):3112-5. doi: 10.1128/JVI.80.6.3112-3115.2006.

引用本文的文献

1
Mechanism of Viral Suppression among HIV Elite Controllers and Long-Term Nonprogressors in Nigeria and South Africa.尼日利亚和南非的 HIV 精英控制者和长期非进展者中病毒抑制的机制。
Viruses. 2022 Jun 10;14(6):1270. doi: 10.3390/v14061270.
2
Impact of Suboptimal APOBEC3G Neutralization on the Emergence of HIV Drug Resistance in Humanized Mice.APOBEC3G 中和效果不佳对人源化小鼠中 HIV 耐药性出现的影响。
J Virol. 2020 Feb 14;94(5). doi: 10.1128/JVI.01543-19.
3
USP49 potently stabilizes APOBEC3G protein by removing ubiquitin and inhibits HIV-1 replication.

本文引用的文献

1
Effect of HIV-1 Vif variability on progression to pediatric AIDS and its association with APOBEC3G and CUL5 polymorphisms.HIV-1 Vif 变异性对儿童艾滋病进展的影响及其与 APOBEC3G 和 CUL5 多态性的关联。
Infect Genet Evol. 2011 Aug;11(6):1256-62. doi: 10.1016/j.meegid.2011.04.020. Epub 2011 May 5.
2
APOBEC3H haplotypes and HIV-1 pro-viral vif DNA sequence diversity in early untreated human immunodeficiency virus-1 infection.APOBEC3H 单倍型与 HIV-1 前病毒 vif DNA 序列多样性在未经治疗的人类免疫缺陷病毒-1 感染早期的研究。
Hum Immunol. 2011 Mar;72(3):207-12. doi: 10.1016/j.humimm.2010.12.008. Epub 2010 Dec 15.
3
USP49 通过去除泛素来稳定 APOBEC3G 蛋白,从而抑制 HIV-1 复制。
Elife. 2019 Aug 9;8:e48318. doi: 10.7554/eLife.48318.
4
Role of APOBEC3H in the Viral Control of HIV Elite Controller Patients.APOBEC3H 在 HIV 精英控制者患者的病毒控制中的作用。
Int J Med Sci. 2018 Jan 1;15(2):95-100. doi: 10.7150/ijms.22317. eCollection 2018.
5
Increased expression with differential subcellular location of cytidine deaminase APOBEC3G in human CD4(+) T-cell activation and dendritic cell maturation.胞苷脱氨酶APOBEC3G在人CD4(+) T细胞活化和树突状细胞成熟过程中表达增加且亚细胞定位不同。
Immunol Cell Biol. 2016 Aug;94(7):689-700. doi: 10.1038/icb.2016.28. Epub 2016 Mar 18.
6
Natural Single-Nucleotide Variations in the HIV-1 Genomic SA1prox Region Can Alter Viral Replication Ability by Regulating Vif Expression Levels.HIV-1基因组SA1近端区域的天然单核苷酸变异可通过调节Vif表达水平改变病毒复制能力。
J Virol. 2016 Apr 14;90(9):4563-4578. doi: 10.1128/JVI.02939-15. Print 2016 May.
7
Extremely High Mutation Rate of HIV-1 In Vivo.HIV-1在体内的极高突变率。
PLoS Biol. 2015 Sep 16;13(9):e1002251. doi: 10.1371/journal.pbio.1002251. eCollection 2015.
8
AID and APOBECs span the gap between innate and adaptive immunity.AID和载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽家族跨越了先天免疫和适应性免疫之间的差距。
Front Microbiol. 2014 Oct 13;5:534. doi: 10.3389/fmicb.2014.00534. eCollection 2014.
9
Upregulation of innate antiviral restricting factor expression in the cord blood and decidual tissue of HIV-infected mothers.上调 HIV 感染母亲脐带血和胎盘组织中固有抗病毒限制因子的表达。
PLoS One. 2013 Dec 18;8(12):e84917. doi: 10.1371/journal.pone.0084917. eCollection 2013.
10
Multiple APOBEC3 restriction factors for HIV-1 and one Vif to rule them all.多种 APOBEC3 限制因子对 HIV-1 起作用,而 Vif 则统领全局。
J Mol Biol. 2014 Mar 20;426(6):1220-45. doi: 10.1016/j.jmb.2013.10.033. Epub 2013 Nov 2.
A single amino acid in human APOBEC3F alters susceptibility to HIV-1 Vif.
人类 APOBEC3F 中的单个氨基酸改变了对 HIV-1 Vif 的易感性。
J Biol Chem. 2010 Dec 24;285(52):40785-92. doi: 10.1074/jbc.M110.173161. Epub 2010 Oct 22.
4
Identification of specific determinants of human APOBEC3F, APOBEC3C, and APOBEC3DE and African green monkey APOBEC3F that interact with HIV-1 Vif.鉴定与人 APOBEC3F、APOBEC3C 和 APOBEC3DE 以及非洲绿猴 APOBEC3F 特异性决定簇,这些决定簇与 HIV-1 Vif 相互作用。
J Virol. 2010 Dec;84(24):12599-608. doi: 10.1128/JVI.01437-10. Epub 2010 Oct 13.
5
Lentiviral Vif degrades the APOBEC3Z3/APOBEC3H protein of its mammalian host and is capable of cross-species activity.慢病毒 Vif 降解其哺乳动物宿主的 APOBEC3Z3/APOBEC3H 蛋白,并具有跨物种活性。
J Virol. 2010 Aug;84(16):8193-201. doi: 10.1128/JVI.00685-10. Epub 2010 Jun 2.
6
Quantitative profiling of the full APOBEC3 mRNA repertoire in lymphocytes and tissues: implications for HIV-1 restriction.定量分析淋巴细胞和组织中完整 APOBEC3 mRNA 谱:对 HIV-1 限制的影响。
Nucleic Acids Res. 2010 Jul;38(13):4274-84. doi: 10.1093/nar/gkq174. Epub 2010 Mar 22.
7
Identification of dominant negative human immunodeficiency virus type 1 Vif mutants that interfere with the functional inactivation of APOBEC3G by virus-encoded Vif.鉴定人免疫缺陷病毒 1 型(HIV-1)Vif 显性负突变体,这些突变体能干扰病毒编码的 Vif 对 APOBEC3G 的功能失活。
J Virol. 2010 May;84(10):5201-11. doi: 10.1128/JVI.02318-09. Epub 2010 Mar 10.
8
Interactions of host APOBEC3 restriction factors with HIV-1 in vivo: implications for therapeutics.宿主 APOBEC3 限制因子与 HIV-1 在体内的相互作用:对治疗的影响。
Expert Rev Mol Med. 2010 Jan 22;12:e4. doi: 10.1017/S1462399409001343.
9
The range of human APOBEC3H sensitivity to lentiviral Vif proteins.人类 APOBEC3H 对慢病毒 Vif 蛋白的敏感性范围。
J Virol. 2010 Jan;84(1):88-95. doi: 10.1128/JVI.01344-09.
10
Analysis of the percentage of human immunodeficiency virus type 1 sequences that are hypermutated and markers of disease progression in a longitudinal cohort, including one individual with a partially defective Vif.对1型人类免疫缺陷病毒序列中发生超突变的百分比以及疾病进展标志物在一个纵向队列中的分析,该队列包括一名Vif部分缺陷的个体。
J Virol. 2009 Aug;83(16):7805-14. doi: 10.1128/JVI.00280-09. Epub 2009 Jun 3.