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利用 SSR 富集焦磷酸测序开发的 13 个微卫星标记用于罗锅底(茄科)及其近缘种。

Thirteen microsatellites developed by SSR-enriched pyrosequencing for Solanum rostratum (Solanaceae) and related species.

机构信息

Biological and Environmental Sciences, School of Natural Sciences, University of Stirling, United Kingdom.

出版信息

Am J Bot. 2011 Oct;98(10):e296-9. doi: 10.3732/ajb.1100159.

DOI:10.3732/ajb.1100159
PMID:21980166
Abstract

PREMISE OF THE STUDY

Microsatellite markers were developed using second-generation sequencing in Solanum rostratum as a tool to study the reproductive biology and genetic structure of this invasive species.

METHODS AND RESULTS

Thirteen microsatellites were successfully discovered and amplified in a single multiplexed PCR. All loci showed genetic variation in S. rostratum. Cross-amplification in five closely related taxa was successful for a subset of loci.

CONCLUSIONS

The set of 13 microsatellite markers developed here provides a time-effective and cost-effective genetic tool to study the reproductive biology of S. rostratum. The demonstrated transferability of the PCR multiplex to related taxa also highlights its usefulness for evolutionary studies across Solanum sect. Androceras.

摘要

研究前提

本研究使用第二代测序技术在刺萼龙葵中开发了微卫星标记,以此作为研究该入侵物种生殖生物学和遗传结构的工具。

方法和结果

在单个多重 PCR 中成功发现并扩增了 13 个微卫星。所有位点在刺萼龙葵中均显示出遗传变异。一组亚位点在五个密切相关的分类群中成功进行了交叉扩增。

结论

这里开发的 13 个微卫星标记集为研究刺萼龙葵的生殖生物学提供了一种省时、经济的遗传工具。PCR 多重扩增在相关分类群中的可转移性也突出了其在茄科龙葵族进化研究中的有用性。

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