Suppr超能文献

烟草青枯病菌 Ralstonia solanacearum 的基因组序列。

Genome sequence of the tobacco bacterial wilt pathogen Ralstonia solanacearum.

机构信息

Department of Agronomy & James D. Watson Institute of Genome Sciences, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China.

出版信息

J Bacteriol. 2011 Nov;193(21):6088-9. doi: 10.1128/JB.06009-11.

Abstract

Ralstonia solanacearum is a causal agent of plant bacterial wilt with thousands of distinct strains in a heterogeneous species complex. Here we report the genome sequence of a phylotype IB strain, Y45, isolated from tobacco (Nicotiana tabacum) in China. Compared with the published genomes of eight strains which were isolated from other hosts and habitats, 794 specific genes and many rearrangements/inversion events were identified in the tobacco strain, demonstrating that this strain represents an important node within the R. solanacearum complex.

摘要

青枯雷尔氏菌是一种引起植物细菌性萎蔫的病原体,在一个异质的种复合体中有数千个不同的菌株。在这里,我们报告了一个从中国烟草(Nicotiana tabacum)中分离出来的菌株 Y45 的基因组序列,它属于 1B 型。与从其他宿主和生境中分离出来的 8 个已发表的菌株的基因组相比,烟草菌株中鉴定出了 794 个特异性基因和许多重排/倒位事件,这表明该菌株代表了青枯雷尔氏菌复合体中的一个重要节点。

相似文献

引用本文的文献

本文引用的文献

5
Genomic DNA k-mer spectra: models and modalities.基因组 DNA k--mer 频谱:模型与模态。
Genome Biol. 2009;10(10):R108. doi: 10.1186/gb-2009-10-10-r108. Epub 2009 Oct 8.
7
Reordering contigs of draft genomes using the Mauve aligner.使用 Mauve 比对工具重新排列草图基因组的顺序。
Bioinformatics. 2009 Aug 15;25(16):2071-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btp356. Epub 2009 Jun 10.
8
SOAP2: an improved ultrafast tool for short read alignment.SOAP2:一种用于短读序列比对的改进型超快速工具。
Bioinformatics. 2009 Aug 1;25(15):1966-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btp336. Epub 2009 Jun 3.
10
RNAmmer: consistent and rapid annotation of ribosomal RNA genes.RNAmmer:核糖体RNA基因的一致性快速注释
Nucleic Acids Res. 2007;35(9):3100-8. doi: 10.1093/nar/gkm160. Epub 2007 Apr 22.

文献AI研究员

20分钟写一篇综述,助力文献阅读效率提升50倍。

立即体验

用中文搜PubMed

大模型驱动的PubMed中文搜索引擎

马上搜索

文档翻译

学术文献翻译模型,支持多种主流文档格式。

立即体验