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GrameneMart:Gramene 项目的 BioMart 数据门户。

GrameneMart: the BioMart data portal for the Gramene project.

机构信息

Cold Spring Harbor Laboratory, 1 Bungtown Road, Cold Spring Harbor, NY 11724, USA.

出版信息

Database (Oxford). 2012 Feb 28;2012:bar056. doi: 10.1093/database/bar056. Print 2012.

DOI:10.1093/database/bar056
PMID:22374386
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3289142/
Abstract

Gramene is a well-established resource for plant comparative genome analysis. Data are generated through automated and curated analyses and made available through web interfaces such as GrameneMart. The Gramene project was an early adopter of the BioMart software, which remains an integral and well-used component of the Gramene website. BioMart accessible data sets include plant gene annotations, plant variation catalogues, genetic markers, physical mapping entities, public DNA/mRNA sequences of various types and curated quantitative trait loci for various species. DATABASE URL: http://www.gramene.org/biomart/martview.

摘要

Gramene 是一个成熟的植物比较基因组分析资源。数据通过自动化和经过验证的分析生成,并通过 GrameneMart 等网络界面提供。Gramene 项目是 BioMart 软件的早期采用者,该软件仍然是 Gramene 网站不可或缺的重要组成部分。BioMart 可访问的数据集包括植物基因注释、植物变异目录、遗传标记、物理图谱实体、各种类型的公共 DNA/mRNA 序列以及各种物种的经过验证的数量性状位点。数据库 URL:http://www.gramene.org/biomart/martview。

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