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关于绘制DNA动力学结构螺旋参数的说明。

A note on graphing helical parameters of dynamics structure of DNA.

作者信息

Galat A

机构信息

Department of Chemistry, Harvard University, Cambridge, MA 02138.

出版信息

J Mol Graph. 1990 Sep;8(3):173-8. doi: 10.1016/0263-7855(90)80060-s.

DOI:10.1016/0263-7855(90)80060-s
PMID:2279014
Abstract

A graphical procedure for analysis of helical parameters in dynamic structure of DNA is described. The performance of the procedure is illustrated by analysis of a 20 ps dynamics simulation of the non-self-complementary ninemer, 5'CAAACAGGA:5'TCCTGTTTG, which is a part of DNA from lacI gene. The dynamics trajectory of the duplex shows sequence-dependent fluctuations of helical parameters.

摘要

描述了一种用于分析DNA动态结构中螺旋参数的图形化方法。通过对非自互补九聚体5'CAAACAGGA:5'TCCTGTTTG(lacI基因DNA的一部分)的20皮秒动态模拟分析,展示了该方法的性能。双链体的动力学轨迹显示了螺旋参数的序列依赖性波动。

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