• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
Pol II CTD kinases Bur1 and Kin28 promote Spt5 CTR-independent recruitment of Paf1 complex.Pol II CTD 激酶 Bur1 和 Kin28 促进 Spt5 CTR 非依赖性募集 Paf1 复合物。
EMBO J. 2012 Aug 15;31(16):3494-505. doi: 10.1038/emboj.2012.188. Epub 2012 Jul 13.
2
Phosphorylation of the transcription elongation factor Spt5 by yeast Bur1 kinase stimulates recruitment of the PAF complex.酵母Bur1激酶对转录延伸因子Spt5的磷酸化作用可刺激PAF复合物的募集。
Mol Cell Biol. 2009 Sep;29(17):4852-63. doi: 10.1128/MCB.00609-09. Epub 2009 Jul 6.
3
The recruitment of the Saccharomyces cerevisiae Paf1 complex to active genes requires a domain of Rtf1 that directly interacts with the Spt4-Spt5 complex.酿酒酵母 Paf1 复合物招募到活性基因需要 Rtf1 结构域,该结构域直接与 Spt4-Spt5 复合物相互作用。
Mol Cell Biol. 2013 Aug;33(16):3259-73. doi: 10.1128/MCB.00270-13. Epub 2013 Jun 17.
4
Control of transcriptional elongation and cotranscriptional histone modification by the yeast BUR kinase substrate Spt5.酵母BUR激酶底物Spt5对转录延伸和共转录组蛋白修饰的调控
Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 Apr 28;106(17):6956-61. doi: 10.1073/pnas.0806302106. Epub 2009 Apr 13.
5
Phosphorylation of the Pol II CTD by KIN28 enhances BUR1/BUR2 recruitment and Ser2 CTD phosphorylation near promoters.KIN28介导的RNA聚合酶II羧基末端结构域(CTD)磷酸化增强了BUR1/BUR2的募集以及启动子附近CTD丝氨酸2位点的磷酸化。
Mol Cell. 2009 Mar 27;33(6):752-62. doi: 10.1016/j.molcel.2009.02.018.
6
Spt6 directly interacts with Cdc73 and is required for Paf1 complex occupancy at active genes in Saccharomyces cerevisiae.Spt6 直接与 Cdc73 相互作用,并且在酿酒酵母中 Paf1 复合物在活性基因上的占据需要 Spt6。
Nucleic Acids Res. 2023 Jun 9;51(10):4814-4830. doi: 10.1093/nar/gkad180.
7
Genetic interactions of Spt4-Spt5 and TFIIS with the RNA polymerase II CTD and CTD modifying enzymes in Saccharomyces cerevisiae.酿酒酵母中Spt4-Spt5和TFIIS与RNA聚合酶II CTD及CTD修饰酶的遗传相互作用。
Genetics. 2001 Oct;159(2):487-97. doi: 10.1093/genetics/159.2.487.
8
Histone deacetylases and phosphorylated polymerase II C-terminal domain recruit Spt6 for cotranscriptional histone reassembly.组蛋白去乙酰化酶和磷酸化的聚合酶II C末端结构域招募Spt6进行共转录组蛋白重新组装。
Mol Cell Biol. 2014 Nov 15;34(22):4115-29. doi: 10.1128/MCB.00695-14. Epub 2014 Sep 2.
9
Interactions between fission yeast Cdk9, its cyclin partner Pch1, and mRNA capping enzyme Pct1 suggest an elongation checkpoint for mRNA quality control.裂殖酵母Cdk9、其周期蛋白伴侣Pch1和mRNA加帽酶Pct1之间的相互作用表明存在一个用于mRNA质量控制的延伸检查点。
J Biol Chem. 2003 Feb 28;278(9):7180-8. doi: 10.1074/jbc.M211713200. Epub 2002 Dec 9.
10
Conditional depletion of transcriptional kinases Ctk1 and Bur1 and effects on co-transcriptional spliceosome assembly and pre-mRNA splicing.条件性敲除转录激酶 Ctk1 和 Bur1 及其对共转录剪接体组装和前体 mRNA 剪接的影响。
RNA Biol. 2021 Nov 12;18(sup2):782-793. doi: 10.1080/15476286.2021.1991673. Epub 2021 Oct 27.

引用本文的文献

1
Unraveling gene expression: a beginner's guide from chromatin modifications to mRNA export in .解析基因表达:从染色质修饰到mRNA输出的初学者指南
Nucleus. 2025 Dec;16(1):2516909. doi: 10.1080/19491034.2025.2516909. Epub 2025 Jun 13.
2
Multiple direct and indirect roles of the Paf1 complex in transcription elongation, splicing, and histone modifications.Paf1 复合物在转录延伸、剪接和组蛋白修饰中的多种直接和间接作用。
Cell Rep. 2024 Sep 24;43(9):114730. doi: 10.1016/j.celrep.2024.114730. Epub 2024 Sep 7.
3
Multiple direct and indirect roles of Paf1C in elongation, splicing, and histone post-translational modifications.Paf1复合物在延伸、剪接和组蛋白翻译后修饰中的多种直接和间接作用。
bioRxiv. 2024 Apr 25:2024.04.25.591159. doi: 10.1101/2024.04.25.591159.
4
Mechanisms and Functions of the RNA Polymerase II General Transcription Machinery during the Transcription Cycle.RNA 聚合酶 II 一般转录机制在转录周期中的机制和功能。
Biomolecules. 2024 Feb 1;14(2):176. doi: 10.3390/biom14020176.
5
Histone H2B ubiquitylation: Connections to transcription and effects on chromatin structure.组蛋白 H2B 泛素化:与转录的关联及其对染色质结构的影响。
Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech. 2024 Jun;1867(2):195018. doi: 10.1016/j.bbagrm.2024.195018. Epub 2024 Feb 6.
6
Cyclin-dependent kinases: Masters of the eukaryotic universe.细胞周期蛋白依赖性激酶:真核生物世界的主宰。
Wiley Interdiscip Rev RNA. 2023 Sep 17;15(1):e1816. doi: 10.1002/wrna.1816.
7
New roles for elongation factors in RNA polymerase II ubiquitylation and degradation.延伸因子在 RNA 聚合酶 II 泛素化和降解中的新作用。
Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech. 2023 Sep;1866(3):194956. doi: 10.1016/j.bbagrm.2023.194956. Epub 2023 Jun 17.
8
Spt6 directly interacts with Cdc73 and is required for Paf1 complex occupancy at active genes in Saccharomyces cerevisiae.Spt6 直接与 Cdc73 相互作用,并且在酿酒酵母中 Paf1 复合物在活性基因上的占据需要 Spt6。
Nucleic Acids Res. 2023 Jun 9;51(10):4814-4830. doi: 10.1093/nar/gkad180.
9
Differential requirements for Gcn5 and NuA4 HAT activities in the starvation-induced versus basal transcriptomes.饥饿诱导的转录组与基础转录组中 Gcn5 和 NuA4 HAT 活性的差异需求。
Nucleic Acids Res. 2023 May 8;51(8):3696-3721. doi: 10.1093/nar/gkad099.
10
The Paf1 complex is required for RNA polymerase II removal in response to DNA damage.Paf1 复合物对于 DNA 损伤响应中 RNA 聚合酶 II 的移除是必需的。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2022 Oct 4;119(40):e2207332119. doi: 10.1073/pnas.2207332119. Epub 2022 Sep 26.

本文引用的文献

1
Cdc73 subunit of Paf1 complex contains C-terminal Ras-like domain that promotes association of Paf1 complex with chromatin.Paf1 复合物的 Cdc73 亚基含有 C 末端 Ras 样结构域,促进 Paf1 复合物与染色质的结合。
J Biol Chem. 2012 Mar 30;287(14):10863-75. doi: 10.1074/jbc.M111.325647. Epub 2012 Feb 8.
2
A universal RNA polymerase II CTD cycle is orchestrated by complex interplays between kinase, phosphatase, and isomerase enzymes along genes.一个通用的 RNA 聚合酶 II CTD 循环是由激酶、磷酸酶和异构酶等酶沿着基因进行复杂相互作用来协调的。
Mol Cell. 2012 Jan 27;45(2):158-70. doi: 10.1016/j.molcel.2011.11.024.
3
Cotranscriptional association of mRNA export factor Yra1 with C-terminal domain of RNA polymerase II.mRNA 输出因子 Yra1 与 RNA 聚合酶 II C 端结构域的共转录关联。
J Biol Chem. 2011 Oct 21;286(42):36385-95. doi: 10.1074/jbc.M111.268144. Epub 2011 Aug 19.
4
Structural insights to how mammalian capping enzyme reads the CTD code.哺乳动物加帽酶如何读取 CTD 密码子的结构见解。
Mol Cell. 2011 Jul 22;43(2):299-310. doi: 10.1016/j.molcel.2011.06.001. Epub 2011 Jun 16.
5
Architecture of the RNA polymerase-Spt4/5 complex and basis of universal transcription processivity.RNA 聚合酶-Spt4/5 复合物的结构和通用转录延伸性的基础。
EMBO J. 2011 Apr 6;30(7):1302-10. doi: 10.1038/emboj.2011.64. Epub 2011 Mar 8.
6
Mpk1 MAPK association with the Paf1 complex blocks Sen1-mediated premature transcription termination.Mpk1 MAPK 与 Paf1 复合物的关联阻止了 Sen1 介导的过早转录终止。
Cell. 2011 Mar 4;144(5):745-56. doi: 10.1016/j.cell.2011.01.034.
7
The chromatin signaling pathway: diverse mechanisms of recruitment of histone-modifying enzymes and varied biological outcomes.染色质信号通路:组蛋白修饰酶募集的多种机制和不同的生物学结果。
Mol Cell. 2010 Dec 10;40(5):689-701. doi: 10.1016/j.molcel.2010.11.031.
8
Crystal structure of the human symplekin-Ssu72-CTD phosphopeptide complex.人源 symplekin-Ssu72-CTD 磷酸肽复合物的晶体结构。
Nature. 2010 Oct 7;467(7316):729-33. doi: 10.1038/nature09391. Epub 2010 Sep 22.
9
Gene-specific RNA polymerase II phosphorylation and the CTD code.基因特异性 RNA 聚合酶 II 的磷酸化和 CTD 密码。
Nat Struct Mol Biol. 2010 Oct;17(10):1279-86. doi: 10.1038/nsmb.1913. Epub 2010 Sep 12.
10
Cooperative interaction of transcription termination factors with the RNA polymerase II C-terminal domain.转录终止因子与 RNA 聚合酶 II C 端结构域的协同相互作用。
Nat Struct Mol Biol. 2010 Oct;17(10):1195-201. doi: 10.1038/nsmb.1893. Epub 2010 Sep 5.

Pol II CTD 激酶 Bur1 和 Kin28 促进 Spt5 CTR 非依赖性募集 Paf1 复合物。

Pol II CTD kinases Bur1 and Kin28 promote Spt5 CTR-independent recruitment of Paf1 complex.

机构信息

Laboratory of Gene Regulation and Development, Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development, Bethesda, MD, USA.

出版信息

EMBO J. 2012 Aug 15;31(16):3494-505. doi: 10.1038/emboj.2012.188. Epub 2012 Jul 13.

DOI:10.1038/emboj.2012.188
PMID:22796944
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3419927/
Abstract

Paf1 complex (Paf1C) is a transcription elongation factor whose recruitment is stimulated by Spt5 and the CDKs Kin28 and Bur1, which phosphorylate the Pol II C-terminal domain (CTD) on Serines 2, 5, and 7. Bur1 promotes Paf1C recruitment by phosphorylating C-terminal repeats (CTRs) in Spt5, and we show that Kin28 enhances Spt5 phosphorylation by promoting Bur1 recruitment. It was unclear, however, whether CTD phosphorylation by Kin28 or Bur1 also stimulates Paf1C recruitment. We find that Paf1C and its Cdc73 subunit bind diphosphorylated CTD repeats (pCTD) and phosphorylated Spt5 CTRs (pCTRs) in vitro, and that cdc73 mutations eliminating both activities reduce Paf1C recruitment in vivo. Phosphomimetic (acidic) substitutions in the Spt5 CTR sustain high-level Paf1C recruitment in otherwise wild-type cells, but not following inactivation of Bur1 or Kin28. Furthermore, inactivating the pCTD/pCTR-interaction domain (PCID) in Cdc73 decreases Paf1C-dependent histone methylation in cells containing non-phosphorylatable Spt5 CTRs. These results identify an Spt5 pCTR-independent pathway of Paf1C recruitment requiring Kin28, Bur1, and the Cdc73 PCID. We propose that pCTD repeats and Spt5 pCTRs provide separate interaction surfaces that cooperate to ensure high-level Paf1C recruitment.

摘要

Paf1 复合物(Paf1C)是一种转录延伸因子,其募集受 Spt5 和 CDK 激酶 Kin28 和 Bur1 的刺激,后者在丝氨酸 2、5 和 7 上磷酸化 Pol II C 端结构域(CTD)。Bur1 通过磷酸化 Spt5 中的 C 端重复序列(CTRs)促进 Paf1C 的募集,我们发现 Kin28 通过促进 Bur1 的募集来增强 Spt5 的磷酸化。然而,不清楚 Kin28 或 Bur1 对 CTD 的磷酸化是否也能刺激 Paf1C 的募集。我们发现 Paf1C 及其 Cdc73 亚基在体外与双磷酸化 CTD 重复序列(pCTD)和磷酸化 Spt5 CTRs(pCTRs)结合,并且消除这两种活性的 cdc73 突变会减少体内 Paf1C 的募集。Spt5 CTR 中的磷酸模拟(酸性)取代在其他野生型细胞中维持高水平的 Paf1C 募集,但在 Bur1 或 Kin28 失活时则不然。此外,在 Cdc73 中失活 pCTD/pCTR 相互作用域(PCID)会降低含有不可磷酸化 Spt5 CTR 的细胞中 Paf1C 依赖性组蛋白甲基化。这些结果确定了一种 Spt5 pCTR 独立的 Paf1C 募集途径,需要 Kin28、Bur1 和 Cdc73 PCID。我们提出 pCTD 重复序列和 Spt5 pCTRs 提供了独立的相互作用表面,共同确保高水平的 Paf1C 募集。