• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

十字捕获系统:酵母蛋白质组学的通用工具。

The Cross-and-Capture system: a versatile tool in yeast proteomics.

机构信息

Quintara Biosciences, Albany CA 9470, United States.

出版信息

Methods. 2012 Dec;58(4):360-6. doi: 10.1016/j.ymeth.2012.07.017. Epub 2012 Jul 24.

DOI:10.1016/j.ymeth.2012.07.017
PMID:22836129
Abstract

High-throughput technologies such as affinity purification and yeast two-hybrid (Y2H) screening have been applied to explore protein-protein interactions (PPIs) in the model organism Saccharomyces cerevisiae. The "Cross-and-Capture" system is an alternative approach for an assessment of PPIs using two arrayed collections of differentially tagged yeast strains. In its current implementation, Cross-and-Capture encompasses ∼500 endogenously tagged yeast proteins, predominantly with roles in DNA metabolism and maintenance. The tagged arrays can also serve other purposes in yeast proteomics, such as monitoring of protein expression and the detection of posttranslational protein modifications. In this article, I summarize the development of this tool and describe its application to detect protein complexes and to screen for novel PPIs.

摘要

高通量技术,如亲和纯化和酵母双杂交(Y2H)筛选,已被应用于探索模式生物酿酒酵母中的蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)。“交叉捕获”系统是一种使用两种差异标记酵母菌株阵列评估 PPIs 的替代方法。在其当前的实现中,交叉捕获包含约 500 个内源性标记的酵母蛋白,主要作用于 DNA 代谢和维持。标记的阵列在酵母蛋白质组学中也可以用于其他目的,如监测蛋白质表达和检测翻译后蛋白质修饰。在本文中,我总结了该工具的发展,并描述了其在检测蛋白质复合物和筛选新的 PPIs 中的应用。

相似文献

1
The Cross-and-Capture system: a versatile tool in yeast proteomics.十字捕获系统:酵母蛋白质组学的通用工具。
Methods. 2012 Dec;58(4):360-6. doi: 10.1016/j.ymeth.2012.07.017. Epub 2012 Jul 24.
2
Examining protein protein interactions using endogenously tagged yeast arrays: the cross-and-capture system.使用内源性标记酵母阵列检测蛋白质-蛋白质相互作用:交叉捕获系统。
Genome Res. 2007 Dec;17(12):1774-82. doi: 10.1101/gr.6667007. Epub 2007 Nov 7.
3
Exploring protein phosphorylation in response to DNA damage using differentially tagged yeast arrays.使用差异标记酵母阵列探索DNA损伤应答中的蛋白质磷酸化。
Biotechniques. 2008 Nov;45(5):581-4. doi: 10.2144/000112949.
4
[Decade of genomics--methods for genome investigation in yeast Saccharomyces cerevisiae].基因组学十年——酿酒酵母基因组研究方法
Postepy Biochem. 2006;52(4):435-47.
5
A novel approach to investigating protein/protein interactions and their functions by TAP-tagged yeast strains and its application to examine yeast transcription machinery.一种通过TAP标签酵母菌株研究蛋白质/蛋白质相互作用及其功能的新方法及其在研究酵母转录机制中的应用。
J Microbiol Biotechnol. 2008 Apr;18(4):631-8.
6
Application of the split-protein sensor Trp1 to protein interaction discovery in the yeast Saccharomyces cerevisiae.分裂蛋白传感器Trp1在酿酒酵母蛋白质相互作用发现中的应用。
Methods Mol Biol. 2012;812:245-58. doi: 10.1007/978-1-61779-455-1_14.
7
Systematic characterization of the protein interaction network and protein complexes in Saccharomyces cerevisiae using tandem affinity purification and mass spectrometry.利用串联亲和纯化和质谱技术对酿酒酵母中的蛋白质相互作用网络和蛋白质复合物进行系统表征。
Methods Mol Biol. 2009;548:187-207. doi: 10.1007/978-1-59745-540-4_11.
8
Quantitative assessment of the structural bias in protein-protein interaction assays.蛋白质-蛋白质相互作用检测中结构偏差的定量评估。
Proteomics. 2008 Nov;8(22):4657-67. doi: 10.1002/pmic.200800150.
9
In vivo quantification of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae using bimolecular fluorescence complementation assay.利用双分子荧光互补测定法在酿酒酵母中进行蛋白质-蛋白质相互作用的体内定量。
J Microbiol Methods. 2010 Nov;83(2):194-201. doi: 10.1016/j.mimet.2010.08.021. Epub 2010 Sep 7.
10
Using guanidine-hydrochloride for fast and efficient protein digestion and single-step affinity-purification mass spectrometry.使用盐酸胍进行快速高效的蛋白质消化和单步亲和纯化质谱分析。
J Proteome Res. 2013 Feb 1;12(2):1020-30. doi: 10.1021/pr300883y. Epub 2012 Dec 26.

引用本文的文献

1
A protein interaction map of the LSU processome.大亚基加工体的蛋白质相互作用图谱。
Genes Dev. 2015 Apr 15;29(8):862-75. doi: 10.1101/gad.256370.114.