• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

施氏假单胞菌 JM300 （DSM 10701）的基因组序列，该菌是一种土壤分离菌，也是自然转化的模式生物。

Genome sequence of Pseudomonas stutzeri strain JM300 (DSM 10701), a soil isolate and model organism for natural transformation.

机构信息

Microbiologia, Departament de Biologia, Universitat de les Illes Balears, Campus UIB, Palma de Mallorca, Spain.

出版信息

J Bacteriol. 2012 Oct;194(19):5477-8. doi: 10.1128/JB.01257-12.

DOI:10.1128/JB.01257-12
PMID:22965097
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3457215/
Abstract

Pseudomonas stutzeri strain JM300 (DSM 10701) is a denitrifying soil isolate and a model organism for natural transformation in bacteria. Here we report the first complete genome sequence of JM300, the reference strain of genomovar 8 for the species.

摘要

施氏假单胞菌 JM300 株（DSM 10701）是一种具有反硝化能力的土壤分离株，也是细菌中自然转化的模式生物。本文报道了 JM300 的首个全基因组序列，该菌株是该物种 8 基因组变种的参考菌株。

相似文献

1
Genome sequence of Pseudomonas stutzeri strain JM300 (DSM 10701), a soil isolate and model organism for natural transformation.施氏假单胞菌 JM300 （DSM 10701）的基因组序列，该菌是一种土壤分离菌，也是自然转化的模式生物。
J Bacteriol. 2012 Oct;194(19):5477-8. doi: 10.1128/JB.01257-12.
2
Draft genome of Pseudomonas stutzeri strain ZoBell (CCUG 16156), a marine isolate and model organism for denitrification studies.ZoBell 氏假单胞菌（CCUG 16156）菌株的基因组草案，该菌株是一种海洋分离株，也是用于反硝化研究的模式生物。
J Bacteriol. 2012 Mar;194(5):1277-8. doi: 10.1128/JB.06648-11.
3
Exchange of chromosomal markers by natural transformation between the soil isolate, Pseudomonas stutzeri JM300, and the marine isolate, Pseudomonas stutzeri strain ZoBell.土壤分离株斯氏假单胞菌JM300与海洋分离株斯氏假单胞菌菌株佐贝尔之间通过自然转化进行染色体标记交换。
Antonie Van Leeuwenhoek. 1991 Jan;59(1):19-25. doi: 10.1007/BF00582115.
4
Complete genome sequence of the nitrogen-fixing and rhizosphere-associated bacterium Pseudomonas stutzeri strain DSM4166.固氮和根际相关细菌施氏假单胞菌 DSM4166 全基因组序列。
J Bacteriol. 2011 Jul;193(13):3422-3. doi: 10.1128/JB.05039-11. Epub 2011 Apr 22.
5
Genome sequence of a highly efficient aerobic denitrifying bacterium, Pseudomonas stutzeri T13.一株高效好氧反硝化细菌——施氏假单胞菌 T13 的全基因组序列。
J Bacteriol. 2012 Oct;194(20):5720. doi: 10.1128/JB.01376-12.
6
DNA restriction is a barrier to natural transformation in Pseudomonas stutzeri JM300.DNA限制是斯氏假单胞菌JM300自然转化的一个障碍。
Microbiology (Reading). 2003 Apr;149(Pt 4):895-901. doi: 10.1099/mic.0.26033-0.
7
Genome sequence of the moderately halotolerant, arsenite-oxidizing bacterium Pseudomonas stutzeri TS44.中度耐盐、亚砷酸盐氧化菌施氏假单胞菌 TS44 的基因组序列。
J Bacteriol. 2012 Aug;194(16):4473-4. doi: 10.1128/JB.00907-12.
8
Genomovars 11 to 18 of Pseudomonas stutzeri, identified among isolates from soil and marine sediment.在从土壤和海洋沉积物中分离出的菌株中鉴定出的斯氏假单胞菌基因组变种11至18。
Int J Syst Evol Microbiol. 2005 Sep;55(Pt 5):1767-1770. doi: 10.1099/ijs.0.63535-0.
9
Natural genetic transformation of Pseudomonas stutzeri in a non-sterile soil.施氏假单胞菌在非无菌土壤中的自然遗传转化
Microbiology (Reading). 1998 Feb;144 ( Pt 2):569-576. doi: 10.1099/00221287-144-2-569.
10
Complete genome sequence of the type strain Pseudomonas stutzeri CGMCC 1.1803.施氏假单胞菌 CGMCC 1.1803 全基因组序列
J Bacteriol. 2011 Nov;193(21):6095. doi: 10.1128/JB.06061-11.

引用本文的文献

1
Comparative genomics of (): diversity, habitats, and biodegradation of aromatic compounds.（）的比较基因组学：芳香族化合物的多样性、栖息地及生物降解
Front Microbiol. 2023 May 15;14:1159176. doi: 10.3389/fmicb.2023.1159176. eCollection 2023.
2
Retraction ATPase Motors from Three Orthologous Type IVa Pilus Systems Support Promiscuous Retraction of the Vibrio cholerae Competence Pilus.ATP 酶马达源自三种同源的 IVa 型菌毛系统，支持霍乱弧菌感受态菌毛的混合缩回。
J Bacteriol. 2022 Jun 21;204(6):e0012622. doi: 10.1128/jb.00126-22. Epub 2022 May 4.
3
Comparative Genomics of Complex: Taxonomic Assignments and Genetic Diversity.复杂生物的比较基因组学：分类归属与遗传多样性
Front Microbiol. 2022 Jan 13;12:755874. doi: 10.3389/fmicb.2021.755874. eCollection 2021.
4
Genomic Analysis of sp. Strain SCT, an Iodate-Reducing Bacterium Isolated from Marine Sediment, Reveals a Possible Use for Bioremediation.sp. 菌株 SCT 的基因组分析，一种从海洋沉积物中分离出的碘酸盐还原菌，揭示了其在生物修复中的可能用途。
G3 (Bethesda). 2019 May 7;9(5):1321-1329. doi: 10.1534/g3.118.200978.
5
Comparative Genomics of sp. Strain SI-3 Associated With Macroalga , the Causative Species for Green Tide in the Yellow Sea.与大型海藻相关的sp.菌株SI-3的比较基因组学，黄海绿潮致病物种
Front Microbiol. 2018 Jul 2;9:1458. doi: 10.3389/fmicb.2018.01458. eCollection 2018.
6
Variable plasmid fitness effects and mobile genetic element dynamics across Pseudomonas species.不同假单胞菌中质粒适应性效应和移动遗传元件动态的可变性。
FEMS Microbiol Ecol. 2018 Jan 1;94(1). doi: 10.1093/femsec/fix172.
7
When Genome-Based Approach Meets the "Old but Good": Revealing Genes Involved in the Antibacterial Activity of Pseudomonas sp. P482 against Soft Rot Pathogens.当基于基因组的方法遇上“经典且实用之物”：揭示参与假单胞菌属P482对软腐病原菌抗菌活性的基因
Front Microbiol. 2016 May 26;7:782. doi: 10.3389/fmicb.2016.00782. eCollection 2016.
8
Draft Genome Sequence of the Toluene-Degrading Pseudomonas stutzeri Strain ST-9.甲苯降解施氏假单胞菌ST-9菌株的基因组序列草图
Genome Announc. 2015 Jun 4;3(3):e00567-15. doi: 10.1128/genomeA.00567-15.
9
Multiple phenotypic changes associated with large-scale horizontal gene transfer.与大规模水平基因转移相关的多种表型变化。
PLoS One. 2014 Jul 21;9(7):e102170. doi: 10.1371/journal.pone.0102170. eCollection 2014.
10
Draft Genome Sequence of Pseudomonas azotifigens Strain DSM 17556T (6H33bT), a Nitrogen Fixer Strain Isolated from a Compost Pile.从堆肥中分离出的固氮菌株阿佐蒂假单胞菌DSM 17556T（6H33bT）的基因组序列草图
Genome Announc. 2013 Oct 31;1(6):e00893-13. doi: 10.1128/genomeA.00893-13.

本文引用的文献

1
Draft genome of Pseudomonas stutzeri strain ZoBell (CCUG 16156), a marine isolate and model organism for denitrification studies.ZoBell 氏假单胞菌（CCUG 16156）菌株的基因组草案，该菌株是一种海洋分离株，也是用于反硝化研究的模式生物。
J Bacteriol. 2012 Mar;194(5):1277-8. doi: 10.1128/JB.06648-11.
2
Complete genome sequence of the type strain Pseudomonas stutzeri CGMCC 1.1803.施氏假单胞菌 CGMCC 1.1803 全基因组序列
J Bacteriol. 2011 Nov;193(21):6095. doi: 10.1128/JB.06061-11.
3
Complete genome sequence of the nitrogen-fixing and rhizosphere-associated bacterium Pseudomonas stutzeri strain DSM4166.固氮和根际相关细菌施氏假单胞菌 DSM4166 全基因组序列。
J Bacteriol. 2011 Jul;193(13):3422-3. doi: 10.1128/JB.05039-11. Epub 2011 Apr 22.
4
Shifting the genomic gold standard for the prokaryotic species definition.动摇原核生物种定义的基因组黄金标准。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 Nov 10;106(45):19126-31. doi: 10.1073/pnas.0906412106. Epub 2009 Oct 23.
5
Aggressive assembly of pyrosequencing reads with mates.将焦磷酸测序读数与配对序列进行积极组装。
Bioinformatics. 2008 Dec 15;24(24):2818-24. doi: 10.1093/bioinformatics/btn548. Epub 2008 Oct 24.
6
Phylogenetic analysis and siderotyping as useful tools in the taxonomy of Pseudomonas stutzeri: description of a novel genomovar.系统发育分析和铁载体分型作为斯氏假单胞菌分类学中的有用工具：一种新型基因组变种的描述
Int J Syst Evol Microbiol. 2008 Oct;58(Pt 10):2309-15. doi: 10.1099/ijs.0.65797-0.
7
Nitrogen fixation island and rhizosphere competence traits in the genome of root-associated Pseudomonas stutzeri A1501.根际关联的施氏假单胞菌A1501基因组中的固氮岛和根际竞争能力性状
Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 May 27;105(21):7564-9. doi: 10.1073/pnas.0801093105. Epub 2008 May 21.
8
Biology of Pseudomonas stutzeri.斯氏假单胞菌生物学
Microbiol Mol Biol Rev. 2006 Jun;70(2):510-47. doi: 10.1128/MMBR.00047-05.
9
Comparative genetic diversity of Pseudomonas stutzeri genomovars, clonal structure, and phylogeny of the species.施氏假单胞菌基因组变种的比较遗传多样性、克隆结构及该物种的系统发育
J Bacteriol. 2004 Aug;186(16):5239-48. doi: 10.1128/JB.186.16.5239-5248.2004.
10
DNA uptake during bacterial transformation.细菌转化过程中的DNA摄取
Nat Rev Microbiol. 2004 Mar;2(3):241-9. doi: 10.1038/nrmicro844.