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通过多重连接依赖探针扩增进行 RHD 和 RHCE 变体及同型合子基因型鉴定。

RHD and RHCE variant and zygosity genotyping via multiplex ligation-dependent probe amplification.

机构信息

Sanquin Research and Landsteiner Laboratory, Academic Medical Centre, University of Amsterdam, and MRC-Holland, Amsterdam, the Netherlands.

出版信息

Transfusion. 2013 Jul;53(7):1559-74. doi: 10.1111/j.1537-2995.2012.03919.x. Epub 2012 Oct 9.

DOI:10.1111/j.1537-2995.2012.03919.x
PMID:23043317
Abstract

BACKGROUND

The presence of a D variant may hamper correct serologic D typing, which may result in D immunization. D variants can be determined via RHD genotyping. However, a convenient single assay to identify D variants is still lacking. We developed and evaluated a multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) assay to determine clinically relevant RHD and RHCE variant alleles and RHD zygosity.

STUDY DESIGN AND METHODS

We analyzed 236 cases (73 normal and 163 selected samples) with the RH-MLPA assay, which is able to determine 79 RHD and 17 RHCE variant alleles and RHD zygosity. To confirm the results, mutations were verified by RHD and/or RHCE exon-specific sequencing and RHD zygosity was verified by quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) for 18 cases.

RESULTS

In 99% of the cases, the RH-MLPA assay correctly determined whether a person carried only wild-type RHD and RHCE alleles (n = 69) or (a) variant RHD allele(s) and/or (a) variant RHCE allele(s) (n = 164). In only three cases, including two new RHD variant alleles, the variant allele was not identified, due to lack of detecting probes. These were RHDDCS2, a new partial RHD allele, RHD525T (Phe175Leu), and a new D- null allele, RHD*443G (Thr148Arg). All RHD (n = 175) and RHCE variant alleles (n = 79) indicated by the RH-MLPA assay were confirmed by sequencing. RHD zygosity was confirmed by quantitative PCR. Two hematopoietic chimeras were recognized.

CONCLUSION

The RH-MLPA genotyping assay is a fast, easy, and reliable method to determine almost all clinically relevant RHD and RHCE variant alleles, RHD zygosity, and RHD+/RHD- chimeras in blood donors, blood recipients, and pregnant women.

摘要

背景

D 变异体的存在可能会干扰正确的血清学 D 型定型,从而导致 D 免疫。D 变异体可通过 RHd 基因分型确定。然而,仍然缺乏一种方便的单一检测方法来鉴定 D 变异体。我们开发并评估了一种多重连接依赖性探针扩增(MLPA)检测方法,以确定临床相关的 RHd 和 RHCE 变异等位基因和 RHd 基因型。

研究设计和方法

我们分析了 236 例(73 例正常和 163 例选定样本)的 RH-MLPA 检测结果,该检测能够确定 79 种 RHd 和 17 种 RHCE 变异等位基因和 RHd 基因型。为了确认结果,我们通过 RHd 和/或 RHCE 外显子特异性测序验证了突变,并通过定量实时聚合酶链反应(PCR)验证了 18 例的 RHd 基因型。

结果

在 99%的情况下,RH-MLPA 检测正确地确定了一个人是仅携带野生型 RHd 和 RHCE 等位基因(n=69)还是携带(一个或多个)变异型 RHd 等位基因和/或(一个或多个)变异型 RHCE 等位基因(n=164)。仅在三种情况下,包括两个新的 RHd 变异等位基因,由于缺乏检测探针,未识别出变异等位基因。这两个新的 RHd 变异等位基因是 RHDDCS2,一个新的部分 RHd 等位基因,和一个新的 D- 无效等位基因,RHD443G(Thr148Arg)。RH-MLPA 检测所指示的所有 RHd(n=175)和 RHCE 变异等位基因(n=79)均通过测序得到证实。RHd 基因型通过定量 PCR 得到确认。两个造血嵌合体被识别出来。

结论

RH-MLPA 基因分型检测是一种快速、简便、可靠的方法,可用于确定献血者、受血者和孕妇中几乎所有临床相关的 RHd 和 RHCE 变异等位基因、RHd 基因型以及 RHd+/RHd-嵌合体。

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