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Rhodococcus 噬菌体 RGL3 和 RER2 的特性及全基因组序列。

Characterization and whole genome sequences of the Rhodococcus bacteriophages RGL3 and RER2.

机构信息

La Trobe Institute for Molecular Sciences, La Trobe University, Melbourne, VIC, Australia.

出版信息

Arch Virol. 2013 Mar;158(3):601-9. doi: 10.1007/s00705-012-1530-5. Epub 2012 Nov 6.

DOI:10.1007/s00705-012-1530-5
PMID:23129131
Abstract

We report here the isolation and genome sequences of two novel phages, lytic for Rhodococcus and Nocardia species. Named RER2 and RGL3, both are members of the family Siphoviridae, and each possesses a novel genome of 46,586 bp and 48,072 bp, respectively. RER2 and RGL3 phages share a modular genome organization, as seen in other sequenced Siphoviridae phage genomes, and appear to share a common evolutionary origin. The genomes of these phages share no similarity with other Rhodococcus or Nocardia phages but are related to Mycobacterium phages. The data presented here extend our understanding of Rhodococcus phage genomics.

摘要

我们在这里报告了两种新型噬菌体的分离和基因组序列,它们可以裂解罗克西亚菌和诺卡氏菌属。分别命名为 RER2 和 RGL3,它们都是肌尾噬菌体科的成员,每个噬菌体分别具有 46586 bp 和 48072 bp 的新型基因组。RER2 和 RGL3 噬菌体具有模块化的基因组组织,与其他已测序的肌尾噬菌体科噬菌体基因组相似,并且似乎具有共同的进化起源。这些噬菌体的基因组与其他罗克西亚菌或诺卡氏菌噬菌体没有相似性,但与分枝杆菌噬菌体有关。这里提供的数据扩展了我们对罗克西亚菌噬菌体基因组学的理解。

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