• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

甲基化标记位于转座元件内的增强子。

Hypomethylation marks enhancers within transposable elements.

出版信息

Nat Genet. 2013 Jul;45(7):717-8. doi: 10.1038/ng.2680.

DOI:10.1038/ng.2680
PMID:23800863
Abstract

Transposable elements (TEs) make up 50% of the human genome and are usually considered a mutational burden. A new study uses signatures of DNA hypomethylation to identify tissue-specific enhancers within TEs, providing fresh evidence that mobile DNA has a non-negligible role in genome regulation and evolution.

摘要

转座元件(TEs)构成了人类基因组的 50%,通常被认为是一种突变负担。一项新的研究利用 DNA 低甲基化的特征来识别 TEs 中的组织特异性增强子,为移动 DNA 在基因组调控和进化中具有不可忽视的作用提供了新的证据。

相似文献

1
Hypomethylation marks enhancers within transposable elements.甲基化标记位于转座元件内的增强子。
Nat Genet. 2013 Jul;45(7):717-8. doi: 10.1038/ng.2680.
2
DNA hypomethylation within specific transposable element families associates with tissue-specific enhancer landscape.特定转座元件家族内的 DNA 低甲基化与组织特异性增强子景观相关。
Nat Genet. 2013 Jul;45(7):836-41. doi: 10.1038/ng.2649. Epub 2013 May 26.
3
Specific subfamilies of transposable elements contribute to different domains of T lymphocyte enhancers.特定的转座元件亚家族有助于 T 淋巴细胞增强子的不同结构域。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Apr 7;117(14):7905-7916. doi: 10.1073/pnas.1912008117. Epub 2020 Mar 19.
4
Contribution of transposable elements and distal enhancers to evolution of human-specific features of interphase chromatin architecture in embryonic stem cells.转座元件和远端增强子对胚胎干细胞中人类特异性间期染色质结构特征进化的贡献。
Chromosome Res. 2018 Mar;26(1-2):61-84. doi: 10.1007/s10577-018-9571-6. Epub 2018 Jan 15.
5
Coordinately Co-opted Multiple Transposable Elements Constitute an Enhancer for wnt5a Expression in the Mammalian Secondary Palate.协同被招募的多个转座元件构成了哺乳动物次生腭中wnt5a表达的一个增强子。
PLoS Genet. 2016 Oct 14;12(10):e1006380. doi: 10.1371/journal.pgen.1006380. eCollection 2016 Oct.
6
Noncoding origins of anthropoid traits and a new null model of transposon functionalization.类人猿性状的非编码起源及转座子功能化的新零模型
Genome Res. 2014 Sep;24(9):1469-84. doi: 10.1101/gr.168963.113. Epub 2014 Jul 20.
7
Characterization of functional transposable element enhancers in acute myeloid leukemia.急性髓系白血病中功能性转座元件增强子的特征。
Sci China Life Sci. 2020 May;63(5):675-687. doi: 10.1007/s11427-019-1574-x. Epub 2020 Mar 6.
8
A family of transposable elements co-opted into developmental enhancers in the mouse neocortex.一个转座元件家族被征募到小鼠新皮质的发育增强子中。
Nat Commun. 2015 Mar 25;6:6644. doi: 10.1038/ncomms7644.
9
Transposable elements as drivers of dedifferentiation: Connections between enhancers in embryonic stem cells, placenta, and cancer.转座元件作为去分化的驱动因素:胚胎干细胞、胎盘和癌症中增强子之间的联系
Bioessays. 2024 Oct;46(10):e2400059. doi: 10.1002/bies.202400059. Epub 2024 Jul 29.
10
Transposable elements as tissue-specific enhancers in cancers of endodermal lineage.转座元件作为内胚层谱系癌症中的组织特异性增强子。
Nat Commun. 2023 Sep 1;14(1):5313. doi: 10.1038/s41467-023-41081-4.

引用本文的文献

1
HSV-1 and Endogenous Retroviruses as Risk Factors in Demyelination.单纯疱疹病毒 1 型和内源性逆转录病毒作为脱髓鞘的危险因素。
Int J Mol Sci. 2021 May 27;22(11):5738. doi: 10.3390/ijms22115738.
2
Methylome of human senescent hematopoietic progenitors.人类衰老造血祖细胞的甲基化组
Exp Hematol Oncol. 2018 Dec 21;7:32. doi: 10.1186/s40164-018-0123-8. eCollection 2018.
3
Expression dynamics and relations with nearby genes of rat transposable elements across 11 organs, 4 developmental stages and both sexes.大鼠转座元件在11个器官、4个发育阶段及雌雄两性中的表达动态及其与邻近基因的关系。

本文引用的文献

1
DNA hypomethylation within specific transposable element families associates with tissue-specific enhancer landscape.特定转座元件家族内的 DNA 低甲基化与组织特异性增强子景观相关。
Nat Genet. 2013 Jul;45(7):836-41. doi: 10.1038/ng.2649. Epub 2013 May 26.
2
Transposable elements are major contributors to the origin, diversification, and regulation of vertebrate long noncoding RNAs.转座元件是脊椎动物长链非编码RNA的起源、多样化及调控的主要促成因素。
PLoS Genet. 2013 Apr;9(4):e1003470. doi: 10.1371/journal.pgen.1003470. Epub 2013 Apr 25.
3
DNA methylation of distal regulatory sites characterizes dysregulation of cancer genes.
BMC Genomics. 2017 Aug 29;18(1):666. doi: 10.1186/s12864-017-4078-7.
4
Transposable Elements in Human Cancer: Causes and Consequences of Deregulation.人类癌症中的转座元件:失调的原因与后果
Int J Mol Sci. 2017 May 4;18(5):974. doi: 10.3390/ijms18050974.
5
Environment-induced epigenetic reprogramming in genomic regulatory elements in smoking mothers and their children.吸烟母亲及其子女基因组调控元件中环境诱导的表观遗传重编程。
Mol Syst Biol. 2016 Mar 24;12(3):861. doi: 10.15252/msb.20156520.
6
Human transgenerational responses to early-life experience: potential impact on development, health and biomedical research.人类对早期生活经历的跨代反应:对发育、健康和生物医学研究的潜在影响。
J Med Genet. 2014 Sep;51(9):563-72. doi: 10.1136/jmedgenet-2014-102577. Epub 2014 Jul 25.
7
Tc1-like transposable elements in plant genomes.植物基因组中的 Tc1 样转座元件。
Mob DNA. 2014 Jun 3;5:17. doi: 10.1186/1759-8753-5-17. eCollection 2014.
8
The 'omics' of adrenocortical tumours for personalized medicine.肾上腺皮质肿瘤的“组学”与个体化医学。
Nat Rev Endocrinol. 2014 Apr;10(4):215-28. doi: 10.1038/nrendo.2013.272. Epub 2014 Feb 4.
9
The role of transposable elements in health and diseases of the central nervous system.转座元件在中枢神经系统的健康和疾病中的作用。
J Neurosci. 2013 Nov 6;33(45):17577-86. doi: 10.1523/JNEUROSCI.3369-13.2013.
远端调控位点的DNA甲基化是癌症基因失调的特征。
Genome Biol. 2013 Mar 12;14(3):R21. doi: 10.1186/gb-2013-14-3-r21.
4
Latent regulatory potential of human-specific repetitive elements.人类特异性重复元件的潜在调控潜力。
Mol Cell. 2013 Jan 24;49(2):262-72. doi: 10.1016/j.molcel.2012.11.013. Epub 2012 Dec 13.
5
Dynamic hydroxymethylation of deoxyribonucleic acid marks differentiation-associated enhancers.脱氧核糖核酸的动态羟甲基化标记分化相关增强子。
Nucleic Acids Res. 2012 Sep 1;40(17):8255-65. doi: 10.1093/nar/gks595. Epub 2012 Jun 22.
6
DNA-binding factors shape the mouse methylome at distal regulatory regions.DNA 结合因子在远端调控区塑造小鼠甲基组。
Nature. 2011 Dec 14;480(7378):490-5. doi: 10.1038/nature10716.
7
A high-resolution map of human evolutionary constraint using 29 mammals.利用 29 种哺乳动物绘制人类进化约束的高分辨率图谱。
Nature. 2011 Oct 12;478(7370):476-82. doi: 10.1038/nature10530.
8
What fraction of the human genome is functional?人类基因组中有多少部分是有功能的?
Genome Res. 2011 Nov;21(11):1769-76. doi: 10.1101/gr.116814.110. Epub 2011 Aug 29.
9
Primate CpG islands are maintained by heterogeneous evolutionary regimes involving minimal selection.灵长类动物 CpG 岛受最小选择参与的异质进化机制控制得以维持。
Cell. 2011 May 27;145(5):773-86. doi: 10.1016/j.cell.2011.04.024.
10
A distal enhancer and an ultraconserved exon are derived from a novel retroposon.一个远端增强子和一个超保守外显子源自一个新型反转录转座子。
Nature. 2006 May 4;441(7089):87-90. doi: 10.1038/nature04696. Epub 2006 Apr 16.