MaGnET：疟疾基因组探索工具。
MaGnET: Malaria Genome Exploration Tool.
机构信息
The University/BHF Centre for Cardiovascular Science, University of Edinburgh, Edinburgh, EH16 4TJ, UK.
出版信息
Bioinformatics. 2013 Sep 15;29(18):2350-2. doi: 10.1093/bioinformatics/btt384. Epub 2013 Jul 27.
SUMMARY
The Malaria Genome Exploration Tool (MaGnET) is a software tool enabling intuitive 'exploration-style' visualization of functional genomics data relating to the malaria parasite, Plasmodium falciparum. MaGnET provides innovative integrated graphic displays for different datasets, including genomic location of genes, mRNA expression data, protein-protein interactions and more. Any selection of genes to explore made by the user is easily carried over between the different viewers for different datasets, and can be changed interactively at any point (without returning to a search).
AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION
Free online use (Java Web Start) or download (Java application archive and MySQL database; requires local MySQL installation) at http://malariagenomeexplorer.org
CONTACT
joanna.sharman@ed.ac.uk or dgerloff@ffame.org
SUPPLEMENTARY INFORMATION
Supplementary data are available at Bioinformatics online.
摘要
疟疾基因组探索工具（MaGnET）是一个软件工具，能够直观地“探索式”可视化与疟原虫（Plasmodium falciparum）功能基因组学数据相关的信息。MaGnET 为不同的数据集提供了创新的集成图形显示，包括基因的基因组位置、mRNA 表达数据、蛋白质-蛋白质相互作用等。用户进行的任何基因选择探索都可以轻松地在不同数据集的不同查看器之间进行传递，并可以在任何时候进行交互更改（无需返回搜索）。
可用性和实现
可在 http://malariagenomeexplorer.org 免费在线使用（Java Web Start）或下载（Java 应用程序存档和 MySQL 数据库；需要本地 MySQL 安装）
联系人
joanna.sharman@ed.ac.uk 或 dgerloff@ffame.org
补充信息
补充数据可在 Bioinformatics 在线获得。
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