• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

中介体 CDK8 模块的结构柔性和功能相互作用。

Structural flexibility and functional interaction of Mediator Cdk8 module.

机构信息

School of Life Sciences, University of Science and Technology of China, Hefei, 230026, China.

出版信息

Protein Cell. 2013 Dec;4(12):911-20. doi: 10.1007/s13238-013-3069-y. Epub 2013 Sep 16.

DOI:10.1007/s13238-013-3069-y
PMID:24043446
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4875398/
Abstract

Mediator is a highly conserved large protein complex (25 proteins, >1000 kDa) and preeminently responsible for eukaryotic transcription, which contains a dissociable 'Cdk8 module'. Although increasing evidence demonstrates that Cdk8 module plays both positive and negative roles in transcription regulation, the detailed structure, and subunit organization, molecular mechanism how it regulates transcription remain elusive. Here we used single-particle electron microscopy to characterize the structure and subunit organization of the Cdk8 module and illuminated the substantial mobility of the Med13 subunit results in the structural flexibility. The Cdk8 module interaction with core Mediator is concurrent with active transcription in vivo. An interaction with the Cdk8 module induces core Mediator into very extended conformation in vitro, which is presumed to be an active functional state of Mediator. Taken together, our results illuminated the detailed architecture of Cdk8 module, and suggested the Cdk8 module could positively regulate transcription by modulating Mediator conformation.

摘要

中介体是一种高度保守的大型蛋白复合物(25 种蛋白,>1000 kDa),主要负责真核转录,其中包含一个可分离的“CDK8 模块”。尽管越来越多的证据表明 CDK8 模块在转录调控中发挥着正反两方面的作用,但它调节转录的详细结构和亚基组织、分子机制仍不清楚。在这里,我们使用单颗粒电子显微镜来描绘 CDK8 模块的结构和亚基组织,并阐明 Med13 亚基的大量移动导致结构的灵活性。CDK8 模块与核心中介体的相互作用与体内的活跃转录同时发生。与 CDK8 模块的相互作用将核心中介体诱导成非常伸展的构象,体外,这被认为是中介体的一种活跃的功能状态。总之,我们的结果阐明了 CDK8 模块的详细结构,并表明 CDK8 模块可以通过调节中介体构象来正向调节转录。

相似文献

1
Structural flexibility and functional interaction of Mediator Cdk8 module.中介体 CDK8 模块的结构柔性和功能相互作用。
Protein Cell. 2013 Dec;4(12):911-20. doi: 10.1007/s13238-013-3069-y. Epub 2013 Sep 16.
2
Mediator kinase module and human tumorigenesis.介质激酶模块与人类肿瘤发生
Crit Rev Biochem Mol Biol. 2015;50(5):393-426. doi: 10.3109/10409238.2015.1064854. Epub 2015 Jul 16.
3
A conserved Mediator-CDK8 kinase module association regulates Mediator-RNA polymerase II interaction.一个保守的中介物-CDK8 激酶模块关联调节中介物-RNA 聚合酶 II 相互作用。
Nat Struct Mol Biol. 2013 May;20(5):611-9. doi: 10.1038/nsmb.2549. Epub 2013 Apr 7.
4
The Cdk8 kinase module regulates interaction of the mediator complex with RNA polymerase II.Cdk8 激酶模块调节中介体复合物与 RNA 聚合酶 II 的相互作用。
J Biol Chem. 2021 Jan-Jun;296:100734. doi: 10.1016/j.jbc.2021.100734. Epub 2021 Apr 30.
5
The SCF-Fbw7 ubiquitin ligase degrades MED13 and MED13L and regulates CDK8 module association with Mediator.SCF-Fbw7 泛素连接酶降解 MED13 和 MED13L,并调节 CDK8 模块与中介体的结合。
Genes Dev. 2013 Jan 15;27(2):151-6. doi: 10.1101/gad.207720.112.
6
Structural basis of the human transcriptional Mediator regulated by its dissociable kinase module.人类转录中介体的结构基础,由其可分离的激酶模块调节。
Mol Cell. 2024 Oct 17;84(20):3932-3949.e10. doi: 10.1016/j.molcel.2024.09.001. Epub 2024 Sep 24.
7
Suppression of Mediator is regulated by Cdk8-dependent Grr1 turnover of the Med3 coactivator.介导物的抑制受 Cdk8 依赖性 Grr1 介导的 Med3 共激活子周转的调控。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Feb 18;111(7):2500-5. doi: 10.1073/pnas.1307525111. Epub 2014 Feb 3.
8
A precisely positioned MED12 activation helix stimulates CDK8 kinase activity.精确定位的 MED12 激活螺旋刺激 CDK8 激酶活性。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Feb 11;117(6):2894-2905. doi: 10.1073/pnas.1917635117. Epub 2020 Jan 27.
9
Distinct roles for Mediator Cdk8 module subunits in Drosophila development.中介体Cdk8模块亚基在果蝇发育中的不同作用。
EMBO J. 2007 Feb 21;26(4):1045-54. doi: 10.1038/sj.emboj.7601566. Epub 2007 Feb 8.
10
A genome-wide RNA interference screen identifies a differential role of the mediator CDK8 module subunits for GATA/ RUNX-activated transcription in Drosophila.全基因组 RNA 干扰筛选鉴定了果蝇中 GATA/RUNX 激活转录的中介 CDK8 模块亚基的差异作用。
Mol Cell Biol. 2010 Jun;30(11):2837-48. doi: 10.1128/MCB.01625-09. Epub 2010 Apr 5.

引用本文的文献

1
Highlighting the Major Role of Cyclin C in Cyclin-Dependent Kinase 8 Activity through Molecular Dynamics Simulations.通过分子动力学模拟突出细胞周期蛋白 C 在细胞周期蛋白依赖性激酶 8 活性中的主要作用。
Int J Mol Sci. 2024 May 15;25(10):5411. doi: 10.3390/ijms25105411.
2
Combining bioinformatics and machine learning to identify common mechanisms and biomarkers of chronic obstructive pulmonary disease and atrial fibrillation.结合生物信息学和机器学习以识别慢性阻塞性肺疾病和心房颤动的共同机制及生物标志物。
Front Cardiovasc Med. 2023 Mar 28;10:1121102. doi: 10.3389/fcvm.2023.1121102. eCollection 2023.
3
Enhanced T cell effector activity by targeting the Mediator kinase module.靶向中介激酶模块增强 T 细胞效应器活性。
Science. 2022 Nov 11;378(6620):eabn5647. doi: 10.1126/science.abn5647.
4
The Cdk8 kinase module regulates interaction of the mediator complex with RNA polymerase II.Cdk8 激酶模块调节中介体复合物与 RNA 聚合酶 II 的相互作用。
J Biol Chem. 2021 Jan-Jun;296:100734. doi: 10.1016/j.jbc.2021.100734. Epub 2021 Apr 30.
5
Structure and noncanonical Cdk8 activation mechanism within an Argonaute-containing Mediator kinase module.含AGO蛋白的中介体激酶模块的结构及非经典Cdk8激活机制
Sci Adv. 2021 Jan 15;7(3). doi: 10.1126/sciadv.abd4484. Print 2021 Jan.
6
Twenty years of Mediator complex structural studies.二十年 Mediator 复合物结构研究。
Biochem Soc Trans. 2019 Feb 28;47(1):399-410. doi: 10.1042/BST20180608. Epub 2019 Feb 7.
7
Med15B Regulates Acid Stress Response and Tolerance in Candida glabrata by Altering Membrane Lipid Composition.Med15B通过改变膜脂组成调节光滑念珠菌的酸应激反应和耐受性。
Appl Environ Microbiol. 2017 Aug 31;83(18). doi: 10.1128/AEM.01128-17. Print 2017 Sep 15.
8
Evolution of disorder in Mediator complex and its functional relevance.中介体复合物中无序状态的演变及其功能相关性。
Nucleic Acids Res. 2016 Feb 29;44(4):1591-612. doi: 10.1093/nar/gkv1135. Epub 2015 Nov 20.
9
Mediator kinase module and human tumorigenesis.介质激酶模块与人类肿瘤发生
Crit Rev Biochem Mol Biol. 2015;50(5):393-426. doi: 10.3109/10409238.2015.1064854. Epub 2015 Jul 16.
10
Redefining the modular organization of the core Mediator complex.重新定义核心中介体复合物的模块化组织。
Cell Res. 2014 Jul;24(7):796-808. doi: 10.1038/cr.2014.64. Epub 2014 May 9.

本文引用的文献

1
A conserved Mediator-CDK8 kinase module association regulates Mediator-RNA polymerase II interaction.一个保守的中介物-CDK8 激酶模块关联调节中介物-RNA 聚合酶 II 相互作用。
Nat Struct Mol Biol. 2013 May;20(5):611-9. doi: 10.1038/nsmb.2549. Epub 2013 Apr 7.
2
Interaction of the mediator head module with RNA polymerase II.中介体头部模块与 RNA 聚合酶 II 的相互作用。
Structure. 2012 May 9;20(5):899-910. doi: 10.1016/j.str.2012.02.023.
3
CDK8 maintains tumor dedifferentiation and embryonic stem cell pluripotency.CDK8 维持肿瘤去分化和胚胎干细胞多能性。
Cancer Res. 2012 Apr 15;72(8):2129-39. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-11-3886. Epub 2012 Feb 16.
4
A structural perspective on Mediator function.从结构的角度看中介作用。
Curr Opin Cell Biol. 2012 Jun;24(3):305-13. doi: 10.1016/j.ceb.2012.01.007. Epub 2012 Feb 15.
5
The structure of CDK8/CycC implicates specificity in the CDK/cyclin family and reveals interaction with a deep pocket binder.CDK8/CycC 的结构暗示了 CDK/周期蛋白家族的特异性,并揭示了与深口袋结合物的相互作用。
J Mol Biol. 2011 Sep 16;412(2):251-66. doi: 10.1016/j.jmb.2011.07.020. Epub 2011 Jul 23.
6
Molecular architecture of the human Mediator-RNA polymerase II-TFIIF assembly.人类中介体-聚合酶 II-TFIIF 组装的分子结构。
PLoS Biol. 2011 Mar;9(3):e1000603. doi: 10.1371/journal.pbio.1000603. Epub 2011 Mar 29.
7
Function and regulation of the Mediator complex.中介复合物的功能和调节。
Curr Opin Genet Dev. 2011 Apr;21(2):225-30. doi: 10.1016/j.gde.2011.01.013. Epub 2011 Feb 15.
8
A TFIIH-associated mediator head is a basal factor of small nuclear spliced leader RNA gene transcription in early-diverged trypanosomes.TFIIH 相关接头头部是早期分化的原生动物小核拼接领导者 RNA 基因转录的基本因子。
Mol Cell Biol. 2010 Dec;30(23):5502-13. doi: 10.1128/MCB.00966-10. Epub 2010 Sep 27.
9
Cyclin-dependent kinase 8 positively cooperates with Mediator to promote thyroid hormone receptor-dependent transcriptional activation.周期蛋白依赖性激酶 8 与中介体协同正向促进甲状腺激素受体依赖性转录激活。
Mol Cell Biol. 2010 May;30(10):2437-48. doi: 10.1128/MCB.01541-09. Epub 2010 Mar 15.
10
Mediator head module structure and functional interactions.中介头模块结构和功能相互作用。
Nat Struct Mol Biol. 2010 Mar;17(3):273-9. doi: 10.1038/nsmb.1757. Epub 2010 Feb 14.