• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

解读全基因组标记数据。

Interpreting Whole-Genome Marker Data.

作者信息

Weir Bruce S

机构信息

Department of Biostatistics, University of Washington, Box 357232, Seattle, WA 98195-7232, USA, Tel.: +1-206-221-7947.

出版信息

Stat Biosci. 2013 Nov;5(2). doi: 10.1007/s12561-013-9090-0.

DOI:10.1007/s12561-013-9090-0
PMID:24273615
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3836609/
Abstract

The challenges of whole-genome data, when genotypes are available from hundreds of thousands of genetic markers, are explored for four topics in statistical genetics: Hardy-Weinberg testing, estimating linkage disequilibrium from unphased genotypic data, association mapping and characterizing population structure.

摘要

当可从数十万遗传标记获得基因型时,针对统计遗传学中的四个主题探讨了全基因组数据的挑战:哈迪-温伯格检验、从不分型的基因型数据估计连锁不平衡、关联作图以及表征群体结构。

相似文献

1
Interpreting Whole-Genome Marker Data.解读全基因组标记数据。
Stat Biosci. 2013 Nov;5(2). doi: 10.1007/s12561-013-9090-0.
2
Detecting marker-disease association by testing for Hardy-Weinberg disequilibrium at a marker locus.通过检测标记位点的哈迪-温伯格不平衡来检测标记与疾病的关联。
Am J Hum Genet. 1998 Nov;63(5):1531-40. doi: 10.1086/302114.
3
SNPAnalyzer 2.0: a web-based integrated workbench for linkage disequilibrium analysis and association analysis.SNPAnalyzer 2.0:一个基于网络的用于连锁不平衡分析和关联分析的集成工作平台。
BMC Bioinformatics. 2008 Jun 23;9:290. doi: 10.1186/1471-2105-9-290.
4
Estimating linkage disequilibrium from genotypes under Hardy-Weinberg equilibrium.在哈迪-温伯格平衡条件下从基因型估计连锁不平衡。
BMC Genet. 2020 Feb 26;21(1):21. doi: 10.1186/s12863-020-0818-9.
5
Testing for linkage and Hardy-Weinberg disequilibrium.连锁与哈迪-温伯格平衡检验。
Ann Hum Genet. 2009 Mar;73(2):253-62. doi: 10.1111/j.1469-1809.2008.00501.x. Epub 2009 Jan 23.
6
QTL fine mapping by measuring and testing for Hardy-Weinberg and linkage disequilibrium at a series of linked marker loci in extreme samples of populations.通过在群体的极端样本中的一系列连锁标记位点测量和检测哈迪-温伯格平衡及连锁不平衡来进行数量性状基因座精细定位。
Am J Hum Genet. 2000 Mar;66(3):1027-45. doi: 10.1086/302804.
7
Single-marker and two-marker association tests for unphased case-control genotype data, with a power comparison.单标记和双标记关联检验用于非相位病例对照基因型数据,并进行了效能比较。
Genet Epidemiol. 2010 Jan;34(1):67-77. doi: 10.1002/gepi.20436.
8
A multilocus model for constructing a linkage disequilibrium map in human populations.一种用于构建人类群体连锁不平衡图谱的多位点模型。
Stat Appl Genet Mol Biol. 2009;8:Article 18. doi: 10.2202/1544-6115.1419. Epub 2009 Feb 26.
9
Evaluation of linkage disequilibrium measures between multi-allelic markers as predictors of linkage disequilibrium between markers and QTL.评估多等位基因标记之间的连锁不平衡度量,作为标记与数量性状基因座之间连锁不平衡的预测指标。
Genet Res. 2005 Aug;86(1):77-87. doi: 10.1017/S001667230500769X.
10
Genetic structure and the search for genotype-phenotype relationships: an example from disequilibrium in the Apo B gene region.基因结构与基因型-表型关系的探寻:载脂蛋白B基因区域失衡的一个实例
Genetics. 1991 Oct;129(2):525-33. doi: 10.1093/genetics/129.2.525.

引用本文的文献

1
HW_TEST, a program for comprehensive HARDY-WEINBERG equilibrium testing.HW_TEST,一个用于全面进行哈迪-温伯格平衡检验的程序。
Genet Mol Biol. 2020 May 11;43(2):e20190380. doi: 10.1590/1678-4685-GMB-2019-0380.
2
Exact Inference for Hardy-Weinberg Proportions with Missing Genotypes: Single and Multiple Imputation.针对存在缺失基因型的哈迪-温伯格比例的精确推断:单重和多重填补
G3 (Bethesda). 2015 Sep 15;5(11):2365-73. doi: 10.1534/g3.115.022111.

本文引用的文献

1
ESTIMATING F-STATISTICS FOR THE ANALYSIS OF POPULATION STRUCTURE.估计用于群体结构分析的F统计量
Evolution. 1984 Nov;38(6):1358-1370. doi: 10.1111/j.1558-5646.1984.tb05657.x.
2
Quality control and quality assurance in genotypic data for genome-wide association studies.全基因组关联研究中基因型数据的质量控制和质量保证。
Genet Epidemiol. 2010 Sep;34(6):591-602. doi: 10.1002/gepi.20516.
3
Distributions of Hardy-Weinberg equilibrium test statistics.哈迪-温伯格平衡检验统计量的分布。
Genetics. 2008 Nov;180(3):1609-16. doi: 10.1534/genetics.108.088005. Epub 2008 Sep 14.
4
Linkage disequilibrium and association mapping.连锁不平衡与关联作图
Annu Rev Genomics Hum Genet. 2008;9:129-42. doi: 10.1146/annurev.genom.9.081307.164347.
5
MENDELIAN PROPORTIONS IN A MIXED POPULATION.混合群体中的孟德尔比例
Science. 1908 Jul 10;28(706):49-50. doi: 10.1126/science.28.706.49.
6
A note on exact tests of Hardy-Weinberg equilibrium.关于哈迪-温伯格平衡精确检验的一则注释。
Am J Hum Genet. 2005 May;76(5):887-93. doi: 10.1086/429864. Epub 2005 Mar 23.
7
Complement factor H polymorphism in age-related macular degeneration.年龄相关性黄斑变性中的补体因子H多态性
Science. 2005 Apr 15;308(5720):385-9. doi: 10.1126/science.1109557. Epub 2005 Mar 10.
8
Estimating F-statistics.估计F统计量。
Annu Rev Genet. 2002;36:721-50. doi: 10.1146/annurev.genet.36.050802.093940. Epub 2002 Jun 11.