• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

通过多重稳定同位素标记对RNA修饰进行分析。

Profiling of RNA modifications by multiplexed stable isotope labelling.

作者信息

Kellner Stefanie, Neumann Jennifer, Rosenkranz David, Lebedeva Svetlana, Ketting René F, Zischler Hans, Schneider Dirk, Helm Mark

机构信息

Institute of Pharmacy and Biochemistry, Johannes Gutenberg University, 5 Staudinger Weg, Mainz, D-55128, Germany.

出版信息

Chem Commun (Camb). 2014 Apr 4;50(26):3516-8. doi: 10.1039/c3cc49114e. Epub 2014 Feb 24.

DOI:10.1039/c3cc49114e
PMID:24567952
Abstract

The combination of (15)N/(13)C stable isotope labelling (SIL) and LC-MS/MS revealed a total of 52 modifications in RNA from E. coli and yeast, including 10 previously undescribed modifications. Two modifications, N-ribosylnicotinamide and 2-methylthioadenosine, were newly detected in species hitherto thought not to contain these modifications.

摘要

(15)N/(13)C稳定同位素标记(SIL)与液相色谱-串联质谱联用技术(LC-MS/MS)相结合,共揭示了大肠杆菌和酵母RNA中的52种修饰,其中包括10种此前未描述的修饰。在迄今认为不含有这些修饰的物种中,新检测到了两种修饰,即N-核糖基烟酰胺和2-甲硫基腺苷。

相似文献

1
Profiling of RNA modifications by multiplexed stable isotope labelling.通过多重稳定同位素标记对RNA修饰进行分析。
Chem Commun (Camb). 2014 Apr 4;50(26):3516-8. doi: 10.1039/c3cc49114e. Epub 2014 Feb 24.
2
Identification of RNA sequence isomer by isotope labeling and LC-MS/MS.通过同位素标记和液相色谱-串联质谱法鉴定RNA序列异构体
J Mass Spectrom. 2014 Nov;49(11):1191-8. doi: 10.1002/jms.3449.
3
Stable Isotope Labeling for Improved Comparative Analysis of RNA Digests by Mass Spectrometry.稳定同位素标记用于提高 RNA 消化物的质谱比较分析。
J Am Soc Mass Spectrom. 2017 Mar;28(3):551-561. doi: 10.1007/s13361-017-1593-3. Epub 2017 Jan 19.
4
The 15N isotope effect in Escherichia coli: a neutron can make the difference.15N 同位素效应在大肠杆菌中的表现:中子可以带来差异。
Proteomics. 2012 Nov;12(21):3121-8. doi: 10.1002/pmic.201200209. Epub 2012 Sep 19.
5
Characterization and quantification of RNA post-transcriptional modifications using stable isotope labeling of RNA in conjunction with mass spectrometry analysis.采用 RNA 稳定同位素标记与质谱分析联用技术对 RNA 转录后修饰进行鉴定和定量。
Anal Chem. 2011 Jun 15;83(12):4894-901. doi: 10.1021/ac200547y. Epub 2011 May 26.
6
Simultaneous quantification of free nucleotides in complex biological samples using ion pair reversed phase liquid chromatography isotope dilution tandem mass spectrometry.使用离子对反相液相色谱同位素稀释串联质谱法同时定量复杂生物样品中的游离核苷酸。
Anal Biochem. 2009 May 15;388(2):213-9. doi: 10.1016/j.ab.2009.02.025. Epub 2009 Feb 27.
7
The Effects of Ultraviolet Radiation on Nucleoside Modifications in RNA.紫外线辐射对 RNA 中核苷修饰的影响。
ACS Chem Biol. 2018 Mar 16;13(3):567-572. doi: 10.1021/acschembio.7b00898. Epub 2018 Feb 5.
8
Absolute and relative quantification of RNA modifications via biosynthetic isotopomers.通过生物合成同位素异构体对RNA修饰进行绝对和相对定量。
Nucleic Acids Res. 2014 Oct;42(18):e142. doi: 10.1093/nar/gku733. Epub 2014 Aug 16.
9
LC-MS Analysis of Methylated RNA.甲基化RNA的液相色谱-质谱联用分析
Methods Mol Biol. 2017;1562:3-18. doi: 10.1007/978-1-4939-6807-7_1.
10
A Vastly Increased Chemical Variety of RNA Modifications Containing a Thioacetal Structure.含有硫代缩醛结构的 RNA 修饰的化学多样性大大增加。
Angew Chem Int Ed Engl. 2018 Jun 25;57(26):7893-7897. doi: 10.1002/anie.201713188. Epub 2018 Apr 27.

引用本文的文献

1
Global analysis by LC-MS/MS of -methyladenosine and inosine in mRNA reveal complex incidence.通过液相色谱-串联质谱法对mRNA中的N⁶-甲基腺苷和肌苷进行全局分析揭示了复杂的发生率。
RNA. 2025 Mar 18;31(4):514-528. doi: 10.1261/rna.080324.124.
2
Stress-induced modification of tRNA generates 5-methylcytidine in the variable loop.应激诱导的 tRNA 可变环中 5-甲基胞苷的生成。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Nov 12;121(46):e2317857121. doi: 10.1073/pnas.2317857121. Epub 2024 Nov 4.
3
Mass Spectrometry Analysis of Nucleic Acid Modifications: From Beginning to Future.
核酸修饰的质谱分析:从起源到未来
Mass Spectrom Rev. 2024 Sep 22. doi: 10.1002/mas.21907.
4
Qualitative and Quantitative Analytical Techniques of Nucleic Acid Modification Based on Mass Spectrometry for Biomarker Discovery.基于质谱的核酸修饰的定性和定量分析技术用于生物标志物发现。
Int J Mol Sci. 2024 Mar 16;25(6):3383. doi: 10.3390/ijms25063383.
5
Reversible oxidative dimerization of 4-thiouridines in tRNA isolates.转运核糖核酸(tRNA)分离物中4-硫尿苷的可逆氧化二聚化作用
RSC Chem Biol. 2024 Feb 1;5(3):216-224. doi: 10.1039/d3cb00221g. eCollection 2024 Mar 6.
6
A Novel Adductomics Workflow Incorporating Software: Rapid Detection of Nucleic Acid Modifications for Studying the Exposome.一种新型的结合组学工作流程,包含软件:快速检测核酸修饰,用于研究外核组。
Environ Sci Technol. 2024 Jan 9;58(1):75-89. doi: 10.1021/acs.est.3c04674. Epub 2023 Dec 28.
7
Biochemical and genetic studies define the functions of methylthiotransferases in methanogenic and methanotrophic archaea.生物化学和遗传学研究确定了甲基硫转移酶在产甲烷古菌和甲烷氧化古菌中的功能。
Front Microbiol. 2023 Nov 23;14:1304671. doi: 10.3389/fmicb.2023.1304671. eCollection 2023.
8
Automated Identification of Modified Nucleosides during HRAM-LC-MS/MS using a Metabolomics ID Workflow with Neutral Loss Detection.基于代谢组学 ID 工作流程及中性丢失检测的 HRAM-LC-MS/MS 中修饰核苷的自动识别
J Am Soc Mass Spectrom. 2023 Dec 6;34(12):2785-2792. doi: 10.1021/jasms.3c00298. Epub 2023 Nov 10.
9
Simultaneous RNA and DNA Adductomics Using Single Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry Analysis.采用单数据非依赖性采集质谱分析技术进行 RNA 和 DNA 加合物组学同步分析。
Chem Res Toxicol. 2023 Sep 18;36(9):1471-1482. doi: 10.1021/acs.chemrestox.3c00041. Epub 2023 Aug 11.
10
Methylated guanosine and uridine modifications in mRNAs modulate translation elongation.信使核糖核酸(mRNA)中的甲基化鸟苷和尿苷修饰可调节翻译延伸。
RSC Chem Biol. 2023 Feb 20;4(5):363-378. doi: 10.1039/d2cb00229a. eCollection 2023 May 10.