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基于相似性聚类预测的黄酮类化合物定量构效关系

QSAR in flavonoids by similarity cluster prediction.

作者信息

Harsa Alexandra M, Harsa Teodora E, Bolboaca Sorana D, Diudea Mircea V

机构信息

Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Babeş-Bolyai University, 400028 Cluj, Romania.

出版信息

Curr Comput Aided Drug Des. 2014;10(2):115-28. doi: 10.2174/1573409910666140410104542.

DOI:10.2174/1573409910666140410104542
PMID:24724899
Abstract

Quantitative Structure-Activity Relationships based on molecular descriptors calculated with correlation weights within the hypermolecule, considered to mimic the investigated correlational space, was performed on a set of 40 flavonoids (PubChem database). The best models describing log P and LD50 of this set of flavonoids were validated by the leave-one-out procedure, in the external test set and in a new version of prediction by using clusters of similar molecules. The best prediction was provided by the similarity cluster procedure.

摘要

基于超分子内用相关权重计算的分子描述符的定量构效关系,被认为可模拟所研究的相关空间,对一组40种黄酮类化合物(PubChem数据库)进行了研究。通过留一法、外部测试集以及使用相似分子簇进行新版本预测,对描述这组黄酮类化合物log P和LD50的最佳模型进行了验证。相似性聚类程序提供了最佳预测。

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