使用竞争性等位基因特异性PCR（KASPar）分析进行单核苷酸多态性（SNP）基因分型

SNP genotyping using KASPar assays.

作者信息

Smith Scott M, Maughan Peter J

机构信息

Department of Plant and Microbial Biology, North Carolina State University, 600 Laureate Way, Kannapolis, 28081, NC,

出版信息

Methods Mol Biol. 2015;1245:243-56. doi: 10.1007/978-1-4939-1966-6_18.

DOI:10.1007/978-1-4939-1966-6_18

PMID:25373762

Abstract

In a separate chapter we describe a simple method for single nucleotide polymorphism (SNP) discovery using genomic reduction. Here we describe a scalable and cost-effective SNP genotyping method based on KBioscience's competitive allele-specific PCR amplification of target sequences and endpoint fluorescence genotyping (KASPar™) using a FRET capable plate reader or Fluidigm's dynamic array high-throughput platform.

摘要

在单独的一章中，我们描述了一种使用基因组缩减进行单核苷酸多态性（SNP）发现的简单方法。在这里，我们描述了一种基于KBioscience的目标序列竞争性等位基因特异性PCR扩增和使用具有荧光共振能量转移（FRET）功能的酶标仪或Fluidigm动态阵列高通量平台进行终点荧光基因分型（KASPar™）的可扩展且经济高效的SNP基因分型方法。