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(S)-cEt-BNA的替代合成:生物活性反义间隙mer序列的关键受限核苷成分。

Alternative syntheses of (S)-cEt-BNA: a key constrained nucleoside component of bioactive antisense gapmer sequences.

作者信息

Salinas Juan C, Migawa Michael T, Merner Bradley L, Hanessian Stephen

机构信息

Department of Chemistry, Université de Montréal , Montréal, Québec H3C 3J7, Canada.

出版信息

J Org Chem. 2014 Dec 5;79(23):11651-60. doi: 10.1021/jo502320y. Epub 2014 Nov 17.

DOI:10.1021/jo502320y
PMID:25401196
Abstract

Approaches to the synthesis of the constrained 5-methyluracil nucleoside (S)-cEt-BNA, a key "gapmer" unit in a number of biologically relevant antisense oligonucleotides, are described using 5-methyluridine as starting material. In the shorter synthesis, a nine-step linear sequence afforded a O-protected (S)-cEt-BNA consisting of a [2.2.1]dioxabicycloheptane core in 7% overall yield. A competing reaction in an intramolecular cyclization of a tosylate led to a bicyclic oxetane.

摘要

描述了以5-甲基尿苷为起始原料合成受限5-甲基尿嘧啶核苷(S)-cEt-BNA的方法,(S)-cEt-BNA是许多具有生物学相关性的反义寡核苷酸中的关键“gapmer”单元。在较短的合成路线中,一个九步线性序列得到了一个O-保护的(S)-cEt-BNA,其具有[2.2.1]二氧杂双环庚烷核心,总产率为7%。在一个甲苯磺酸酯的分子内环化反应中,一个竞争反应导致了双环氧杂环丁烷的形成。

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